南迁并非不行，长江中游有左良文十万大军，下游又有赵谦海陆军队扼守长江天堑，南京比京师要安全得多，即使北方陷落，偏安于江南，还是有可能的。
但是南迁意味着放弃宗庙陵寝，难以启口，必须有内阁、六部的重臣出来力排众议，形成朝廷一致的共识。遗憾的是，那些大臣都怕承担骂名，不敢提倡南迁。
赵谦的奏书诚恳至极，并称愿意交出江南兵权为朱由检所用（当然只是说说），于是朱由检向内阁六部大臣提出“朕愿督师”，以试探水深，遗憾的是，大臣们争先恐后表示愿意“代帝出征”，没有一个人提到“南迁”。
形势越来越紧急。李自成东征后，发布声讨明朝的檄文，其中言：“君非甚黯，孤立而炀蔽恒多；臣尽行私，比党而公忠绝少”，引起了极大的震动。
朱由检单独召见驸马都尉巩永固（光宗之女，安乐公主的丈夫），向这位皇亲国戚征询救急对策。巩永固极力鼓动皇帝“南迁”，如果困守京师，是坐以待毙。
不久，李明睿公开上疏，建议“南迁”。他说：如果皇帝“南迁”，京营兵可以护驾，沿途还可以招募数十万士兵。山东的一些王府可以驻跸，凤阳的中都建筑也可以驻跸，南京有史可法、赵谦可以寄托大事，建立中兴大业。京师可以委托给魏藻德、方岳贡等内阁辅臣，辅导太子，料理善后事宜。
朱由检把他的奏疏交给内阁议论。内阁首辅陈演反对“南迁”，示意兵科给事中光时亨，严厉谴责李明睿的“邪说”，声色俱厉地扬言：不杀李明睿，不足以安定民心。
李明睿不服，极力为“南迁”声辩，援引宋室“南迁”后，国祚延续一百五十年的先例，反复论证，只有“南迁”才可以有中兴的希望。
朱由检对光时亨的意见很是反感，当面训斥他是出于“朋党”的意气用事，下达圣旨：“光时亨阻朕南迁，本应处斩，姑饶这遭。”态度虽然十分坚决，但是大臣们都缄口不言。
都察院左都御史李邦华是支持李明睿的，他写给皇帝的秘密奏疏，提出折中方案，派遣太子“南迁”，把南京作为陪都，留下一条退路，维系民众的希望。朱由检看了他的奏疏，赞叹不已，兴奋得绕着宫殿踱步，把奏折揉烂了还不放手。立即召见内阁首辅。（温体仁死后，朱由检考虑到周延儒在东林中的声望，放弃用他做首辅，不久前陈演进内阁首辅大臣。）
朱由检说：李邦华说得对！陈演是坚决反对“南迁”的，故意向外透露了这个消息，并且鼓动言官猛烈抨击“南迁”的主张。
朱由检感受到“南迁”的压力，立场发生微妙的变化，他再次召见内阁辅臣时，作出了和他的本意大相径庭的决定：死守京师。他的理由是：如果朕一人单独而去，宗庙社稷怎么办？陵寝怎么办？京师百万生灵怎么办？国君与社稷同生死，是道义的正统。
阁臣们建议，让太子“南迁”，延续国祚。
朱由检反驳道：朕经营天下十几年，尚且无济于事，太子这样的哥儿孩子家，做得了什么事？先生们乘早研究战守的对策，其他的话不必再讲了。
朱由检在“南迁”问题上，实在是身不由己，关键在于内阁首辅陈演坚决反对。陈演也有压力，不得不乞求辞职。
朱由检在罢免他的前一天，对陈演说了这样一句意味深长的话：“朕不要做，先生偏要做；朕要做，先生偏不要做。”对这位辅政大臣的消极辅政，显得无可奈何。
所谓“朕要做，先生偏不要做”的事，就是“南迁”。
继任的内阁首辅魏藻德，更加老奸巨猾，采取明哲保身的态度，对“南迁”不置可否。当巩永固、项煜提议“南迁”时，他都在场，始终一言不发，用沉默来表示委婉的否定。使得朱由检感到孤立无援，在龙椅上耸身舒足，仰天长叹。
周皇后为此感叹不已，她是江南人，倾向于“南迁”，由于无法成行，遗憾地说：可惜朝廷没有有力的支持者。一语道破其中的奥秘。
于是赵谦想辅佐朱由检中兴大明的梦想完全破裂了。
崇祯十七年正月十七日半夜，守城太监曹化淳率先打开外城西侧的广甯门，农民军由此进入南郊一带。正月十八日，李自成派在昌平投降的太监杜勋入城与崇祯秘密谈判。
李自成提出的条件为：“闯人马强众，议割西北一带分国王并犒赏军百万，退守河南闯既受封，愿为朝廷内遏群寇，尤能以劲兵助剿辽藩。但不奉诏与觐耳。”
崇祯直接痛骂滚蛋，双方谈判破裂。
赵谦闻得京师局势，犹豫不决，韩佐信去了浙江，邹维涟赵逸臣等也在浙江处理海事，赵谦身边没有信得过的谋士，欲与人商议而不得。
赵谦军驻扎在保定府修整，弹药粮草充足。大帐外面一列列的黑甲骑兵往来不息，战力精锐。
但是这个时候，赵谦却不想去京师了。去京师做什么呢？难道要他带着一两万人和李自成号称百万的大军硬拼么？有飞机坦克还差不多。
赵谦觉得，南迁才是明智之举，关键是朝廷内部不愿意南迁，赵谦去了京师，实在不知道能干什么。
当然不能胁迫朱由检离开京师，那样是谋逆，后果很复杂，不好处理。
正在赵谦按兵不动的当口，朱由检又下了罪己诏。
制曰：
朕嗣守鸿绪十有七年，深念上帝涉降之威，祖宗托付之重朕为民父母，不得而卵翼之，民为朕赤子，不得而襁褓之，坐令秦豫丘墟，江楚腥秽，贻羞宗社，致疚黔黎，罪非朕躬，谁任其责？所以使民罹难锋镝，蹈水火，堇量以壑，骸积成丘，皆朕之过也。使民输驺挽栗，居送行赉，加赋多无艺之征，预征有称贷之苦，又朕之过也。使民室如悬磐，田卒污莱，望烟火而无门，号泣风而绝命，又朕之过也。使民日月告凶，旱潦存至，师旅所处，疫蔓为殃，上干天地之和，下丛室家之怨，又朕之过也。至于任大臣而不法，用小臣而不廉，言官前鼠而议不清，武将骄懦而功不举，皆朕抚驭失宜忠君爱国，人有同心，雪耻除凶，谁无公愤！
朕以藐躬，上承祖宗之丕业，下临亿兆于万方，十有七载于兹。政不加修，祸乱日至。抑圣人在下位欤？至于天怒，积怨民心，赤子沦为盗贼，良田化为榛莽；陵寝震惊，亲王屠戮。国家之祸，莫大于此。今且围困京师，突入外城。宗社阽危，间不容发。不有挞伐，何申国威！朕将亲率六师出讨，留东官监国，国家重务，悉以付之。告尔臣民，有能奋发忠勇，或助粮草器械，骡马舟车，悉诣军前听用，以歼丑类。分茅胙土之赏，决不食言！
二月九日清晨，兵部左尚书张缙彦主动打开正阳门，迎刘宗敏军，京师不攻自破。
绝望无助的崇祯帝强打精神举行了最后一次家宴，当夜酒宴罢后，崇祯帝即安排太子慈烺、三子定王慈灿、四子永王慈焕逃离皇宫。
随后，崇祯帝在宫中亲自持剑砍杀妻妾、女儿，幼女昭仁公主致死，长女长平公主断臂重伤，一生贤德的周皇后于坤宁宫自缢。十九日凌晨，天将曙明，崇祯揩御笔太监王承恩离开紫禁城，登上皇家禁苑煤山，在一株老槐树下自缢身亡，时年33岁。死时“以发覆面，白袷蓝袍白细裤，一足跣，一足有绫袜”，衣上以血指书。
朕自登极十七年，逆贼直逼京师，虽朕薄德匪躬，上干天怒，致逆贼直逼京师，然皆诸臣之误朕也，朕死，无面目见祖宗于地下，自去冠冕，以发覆面，任贼分裂朕尸，勿伤百姓一人。
