莫比斯基金会的一座实验室。
凯姐带着EVA来这座实验室搞破坏，接着EVA看到了泽拉图的基地，于是暂时告别凯姐，去找泽拉图。有了这么一个掌握特殊技术的人类的帮忙，泽拉图和他的星灵兄弟们比原位面更快的找到了被关押的圣堂武士，以及一个地址，Atranis。
前往Atranis，消灭看门的Tal'darim（塔达利姆），进入神庙，找预言。这里开始和原位面产生巨大的差异，最后留下来的不是那只美女星灵Talis（塔莉思）和她的圣堂武士，而是EVA随手招来的几十名改进版陆战队员和医疗兵，这些兵力足够拖住埃蒙的虚空军团，成功使三个“领导”和昂贵的星灵圣堂武士乘坐VoidSeeker（虚空寻觅者号）离开这颗星球。
随身空间就得这样用，克隆人军团随时做好了牺牲的准备，就等指挥官一声令下。
成功救下塔莉思让EVA感到非常振奋，这引起了塔莉思的怀疑。
“人类，自从离开Atranis你就一直处于一种兴奋状态，能告诉我为什么吗？”
“噢……不好意思啊，圣堂武士，暂时是个秘密，不过你会知道的。”
泽拉图愿意相信这个人类，就和他相信詹姆斯-雷诺一样相信EVA，毕竟EVA身上藏着那块伊安水晶，而他居然感觉不到具体在哪……
……
一段旅行后，泽拉图带着两只强大的“花瓶”找到达拉姆的大主教阿塔尼斯，大主教的副官赛兰蒂斯看见泽拉图后就想刀兵相向，不过，这次不一样了，塔莉思取代大主教叫住了赛兰蒂斯的进一步行动。
“你不相信他，那可以相信我吗？”
“这是最伟大的战斗，这是最后一战，我不会放弃！”
“噢！天哪！你们根本不知道现在艾尔的表面有什么在等你们！我们必须放弃这次进攻！否则就将面对难以接受的损失！”
“难道你知道？”
“……我……”塔莉思看着泽拉图，“我怎么会知道呢？”
“告诉我们，你知道什么？”泽拉图对塔莉思说道。
“如果你坚持要下去，执行官，那我请求你，以及你的战士们，切断卡拉，就像这样！”塔莉思切掉了自己的神经束，趴在地上缓了缓，看向阿塔尼斯，“埃蒙就在下面，他已经污染了卡拉！”
原位面的大主教可没有这么犹豫不决，否则就没有F2A的正篇第一关了。不过现在，情况变了，变化非常大。
泽拉图请求停止进攻可以理解，但塔莉思切掉自己的神经束……这实在是太令人惊悚了。
“好了，别争辩了，既然想知道下面有什么，就去看看！塔莉思留下，泽拉图、赛兰蒂斯，我们三个下去。”大主教下定决心了。
“好的。”泽拉图回应道。
“黑暗教长，你的船我先帮你看管了。”EVA通过特制的通讯设备给泽拉图发话。得到了肯定的回复。EVA驾驶虚空寻觅者远离了艾尔。不过，是EVA的一个精锐复制人战士驾驶虚空寻觅者，EVA本人则悄悄跟随大主教三人，前往艾尔。
原本的大军进攻变成了几个人的特别行动……
幸运的是，埃蒙没有改变计划，在三只星灵登陆后不久，便通过卡拉控制了阿塔尼斯和赛兰蒂斯。
正当泽拉图准备一挑二玩牺牲的时候，EVA出现了。
“你怎么……”
“没时间解释了，先切断他俩的神经束；塔莉思已经知道了，沙库拉斯也知道了，一些暗影卫队的战士正在帮助塔莉思切黄金舰队的战士的神经束。”
“噢，好的。”
通过阿塔尼斯，埃蒙吼道：“你这个卑微的人类！竟敢破坏我的计划！我要你死……”
“对不起啊！黑暗之神，你一直都不是主角。”
……
轻松写意的，黄金舰队通过正确的方式占领了他们的母星——艾尔。不过，危机并没有解除。
得到众人信任的EVA叫上相位技师凯拉克斯，启动亚顿之矛。在艾尔，赛兰蒂斯和塔莉思两大美女执政官留下掠阵，阿塔尼斯、泽拉图、EVA、凯拉克斯四人登上亚顿之矛，EVA的克隆人精锐驾驶虚空寻觅者接入亚顿之矛，他们的冒险还在继续。
亚顿之矛离开艾尔轨道后，泽拉图带着那名克隆人精锐驾驶虚空寻觅者前往克哈，EVA则跟着阿塔尼斯前往沙库拉斯。
据说，这是为了避免泽拉图见到沃拉尊时剑拔弩张的尴尬……
等泽拉图带兵搞掉莫比斯军团在克哈上的基地，带走钥石，定位亚顿之矛的时候，发现大主教……还在沙库拉斯……
当虚空寻觅者号回到亚顿之矛的港湾，泽拉图前往舰桥，看到主屏幕上投放的一切时，和沃拉尊一样，被惊呆了。
沙库拉斯上不知何时多出一处虫巢，和埃蒙控制的虫群正面交锋，尽管埃蒙的虫群更为庞大，并且还有少数混合体助阵，但很明显，几乎每个战区，埃蒙的军团都是被压着打的……
经过仔细辨认，泽拉图更为惊讶，因为和埃蒙对抗的虫巢，与他前往Atranis星球之前，见到的凯瑞甘的虫群，几乎一模一样……
不，不是几乎，就是凯瑞甘的一支虫巢部队部署到了沙库拉斯，把埃蒙虫群压着打……
再看到疑似凯瑞甘虫群的部队里有一些属于人类的火力时，泽拉图感觉到，他们多出了一位强大的盟友。
“阿塔尼斯！那个人类，EVA，她现在在哪？”
“沙库拉斯表面指挥那批虫巢部队对抗埃蒙。看到那块埃蒙几乎被堵回去的传送门吗？她就在那附近。”
当泽拉图转过眼去看那个区域，虫巢部队甚至推进了传送门，接着，其他区域的埃蒙虫群攻击发生了停滞，变成就地防守。
不过，之前有提过，原版的虫群是洪水，改版后的凯姐的虫群是海啸；EVA带来的虫巢站稳脚跟后，直接就是海啸逆推洪水，各个传送门在一天里全都被逆推，打到对面后，门外传出混合体的吼叫，然后，传送门被关闭……
“好的，沃拉尊和……泽拉图？我没想到你动作会这么快！”
“你的能力令我和我的弟兄们感到惊讶，人类EVA，但是，我想知道，你找沃拉尊族长和泽拉图有什么事？”阿塔尼斯率先发话。
“好的，这个还是问问女族长吧，女族长！看到我的实力后，你是否愿意留下一点黑暗圣堂武士留守这颗星球呢？”
“你的计划是？”
“我打算吸引更多的埃蒙仆从前来沙库拉斯，而我又不希望不够精锐的暗影卫队留下来造成不必要的伤亡。所以，我请求你留下一些黑暗圣堂武士，你本人也可以，毕竟泽拉图还有他的使命。”
“……好的，我可以相信你，人类。我会留下来。”
“你当然得留下，我还有任务呢！不说了，等我回亚顿之矛……嘿！阿塔尼斯！让你的人打开护盾放我进去！”
“哦……噢……好的！”
……
