1945年抗战胜利后，章家人终于从四面八方汇聚到家乡南昌。然而，叫周锦华猝不及防的是，分别六年的丈夫章贡涛从庐山带下了一位年纪尚轻的女士曹筱玉，先行住进了县前街章宅，性格倔犟的周锦华既没有做出妻妾相安的大度之举，也没有啼哭吵闹，而是选择了出人意料的办法——孤傲地搬出来另住。让儿子章浩若给她在井头巷寻得了一幢平房，自己带着晚辈离开了章氏老宅。事实上，此时的章老太太已经成了独立的周锦华女士。
不久，由于蒋经国奉派赴东北任特派员，参加对苏联的谈判，为了便于暗中照应章孝严、章孝慈两兄弟，他决定将章浩若调至身边，让章浩若亦远赴东北，出任辽宁省法库县县长，直到蒋经国在东北的工作告一段落返回南京后，才放章浩若归家乡江西省就职浮梁县县长。因此，在南昌期间，抚养、教育章孝严、章孝慈的重担几乎都压在了他们的外婆周锦华的肩上。章氏兄弟的启蒙生涯也正是在这一时期开始的，周锦华为他们选择了一所教会学校——弘道国民小学，让他们接受正规的西式教育。在1947年，也就是章孝严、章孝慈两兄弟5周岁的时候，当时在南京的蒋经国，曾派人通知周锦华，带着大毛、小毛前去相聚。这是章孝严、章孝慈两兄弟落世后，父子的第一次见面。然而，在当时的情形之下，蒋经国仍然没有勇气公开声言为自己的行为负责，来捅破这层纸。两个年幼无知的孩童“不明其理”，自然也对这次“莫名”的相见没有留下什么印象和记忆。平日里，蒋经国与章家之间的联络、主要是通过亲信王升暗中传递。
1949年，国民党政权在大陆的统治败局已定。仓皇之中，蒋经国紧急安排章氏家族举家迁台，由于章贡涛热土难离，坚持留守家园，章浩若在浮梁县长任上被中国人民解放军俘获未及撤去，周锦华最后只得携领章孝严、章孝慈两兄弟，以及大儿媳纪琛、二儿子瀚若、长孙修纯等一家10口辞别家乡南昌，辗转经厦门与王升家眷一起乘船到了台湾。他们先在基隆滞留了数日，然后就南下去了新竹，并在那里定居下来。几年以后，由于章孝严、章孝慈的大舅妈纪琛因牵挂不下留在海峡对岸的丈夫，携领自己的3个亲生儿女转道香港返回了大陆。这样，抚养章孝严、章孝慈两个“孤儿”的重担再次落在了他们的外婆周锦华以及二舅章瀚若的肩上。
50年代，新竹在台湾是一个相对偏僻、保守、落后的城镇，民风淳厚，生活也比较艰难。周锦华带着章家晚辈难民般地流亡至此，已是家财散尽，私蓄无几，以往的宽绰、优裕让位于捉襟见肘，而她孤傲的性格也决定了她绝不会向那位名实不符的“女婿”蒋经国低头求援，而甘愿过着问心无愧的清贫生活，苦度岁月。
章瀚若在大陆时期读的是商业专科学校，有一定的经济头脑，因此在新竹定居之时，他颇出人意料地选择了当时一般由大陆迁台者都不愿前往的商业街——中央路的一处住所，前店后家，决定做生意，要赚钱，要自己养家糊口。他先后卖过日用品，卖过烟酒也经营过碾米厂生意。章孝严后来回忆说：整条街上，“他是惟一大学毕业做生意的年轻人”。“那段时间，左邻右舍都是本省籍同胞。我们是惟一从大陆来，在当地开起铺子的外省人”。可惜，章瀚若的苦心经营都不太成功，生意极其清淡。但终归可以糊口，可以养育两个外甥上学读书了。
在外婆和二舅的庇护之下，章孝严、章孝慈两兄弟的求学生涯虽然艰苦，但毕竟没有大的波折。先是入新竹东门国小就读高小，然后又一同在中坜中学念完初中，最后章孝严在省立新竹中学、章孝慈在私立义民中学就读高中。1961年，周锦华因病去世后不久，兄弟俩又一同考人台湾东吴大学，一人外文系，一人法律系学习。
从懂事之日起，章孝严、章孝慈就开始受到身世问题的困扰。他们俩读书时，户籍上父亲栏填的是大舅章浩若，母亲栏填的是舅母纪深。同时，为了避人耳目，章孝严的出生日期写的是1941年5月20日，章孝慈的出生日期写的是1942年1月24日。究竟谁是自己的亲生父母？章孝严、章孝慈兄弟俩茫然不知其解，而周锦华则自始至终守口如瓶。她担心，无论是不堪回首的过去，还是无法预测之未来，一旦展示出来，徒增痛苦而已！因此，天大的事她独自承担了，所有的恩怨爱恨，她全埋葬进了心底。
故而，每当他们向外婆相询时，她不是言“你们长大后自然就会明白”，就是搪塞：“你们的父母都在大陆，没有能来台湾。”直到临终之时，周锦华也没有或者可以说不愿对两兄弟的身世透露半句。对此，章孝严、章孝慈虽然深感缺憾，但并没有特别的精神负担。章孝严后来曾深有感触地讲：“虽然母亲早逝，父亲没有办法在身边，可是我觉得童年并不缺少爱。外婆的爱意与舅舅的关切，把父母留下的真空填补起来了，而我的人格也才得以正常发展。”
在章孝严、章孝慈兄弟二人的成长道路上，外婆周锦华无疑是他们最感敬佩的长辈与尊者，章孝严长大以后特别怀恋外婆与他们相依为命的那段难忘岁月：“她把所有的精神与关爱都放在我和弟弟身上，抚养我们。”“她坚强的意志力、不向恶劣环境低头的作风，以及她慈爱的胸怀，把我和弟弟从非常困难的环境中抚养长大，对我都有很深远的影响。她让我具有比一般同年龄人较大的耐力，也有较明显的沉着力量。记忆所及，从小外婆管教我和弟弟非常严格，她爱我们却从不宠我们。她对做人的道理要求非常严格。每想到外婆，就想到李密写的《陈情表》：‘臣无祖母，无以至今日；祖母无臣，无以终余年。’每念到这里，心中就有无限感伤。外婆去世也早了一点。她的离去，对我而言，是人生首次面临的最大打击之一。”
在东吴大学，章孝严、章孝慈兄弟俩同校不同系，章孝严醉心政治，章孝慈则进行法学研究。李登辉在台湾承认两人是蒋家后代，以后兄弟两人也不讳言。但蒋家，特别是宋美龄并未表态。
章孝严自小就对政治兴趣浓厚，东吴大学外文系毕业后就分到中坜忠爱庄的“国防部”政治作战总队当政战预备官，并曾被派往金门受训。退役后，一度到虎尾中学任教。其后，赴美人乔治城大学留学，专攻外交和国际政治，获硕士学位。返台后，于1967年通过台湾“外交部”领事人员乙等特考，获第四名的优异成绩，从此进入台湾“外交部”。
在接受了10个月的“外交”领事人员训练后，l968年，以“外交部”学员身份派往台湾驻比利时“使馆”工作，并人布鲁塞尔大学进修法文。两年后实习结束返回台湾，一度在“外交部，档案资料当科员，不久调往欧洲司，担任陈雄飞“次长”的秘书。1974年2月，章孝严以三等秘书衔，外放台湾驻美“大使馆”。1977年7月，他再度被调回台湾“外交部”，升任有“天下第一司”之称的“北美司一科科长”。
在此期间，他又以《珍宝岛事件》的论文，通过了“外交部”领事人员甲等特考。1980年，升任“外交部”专门委员、“北美司”副司长、“北美事务协调委员会”副秘书长。1981年，升任该会秘书长。1982年接替程建人，升任“北美司”司长。1986年8月，原“常务次长”关镛奉命出使沙特阿拉伯，由章孝严继任，时年44岁，被誉为台湾外交界的明日之星。1989年章孝严出任国民党中央海外工作会主任，1990年再返“外交部”任“政务次长”。1992年转任国民党中央侨务委员会委员长。是国民党十三届、十四届中央委员。
与哥哥醉心于政治、在仕途上步步高升的境况有所不同，弟弟章孝慈则一直有志于治学，潜心于法学研究。在海外留学归来后，长期在东吴大学执教，硕果盈盈，学术地位令人尊崇，先后担任过东吴大学法学院院长、教务长、副校长、校长。也是国民党十三届中央委员。
章孝严、章孝慈两兄弟来到台湾以后，一切情形仍然是由王升居中转告给蒋经国。1961年周锦华去世后，也是由王升亲口将章孝严、章孝慈的身世之谜点破，他们被告知生父就是蒋经国。然而妨碍父子公开确认的所有顾忌仍然存在，双方都深知此“内幕”一旦曝光对于台湾政坛，对于蒋家王朝的统治将产生怎样的震撼！因此，一如既往，亲情让位于现实政治，他们对外都三缄其口，彼此心照不宣。尤其是蒋经国始终保持高度谨慎，十分注意不与章孝严、章孝慈两兄弟同时公开露面，也从不向任何人谈论到他们。章孝严大学毕业后服兵役时，最初在复兴岗受训，蒋经国破例没有去训话，后来在成功岭受训，蒋经国又一次破例没有前来训话。而章孝严、章孝慈多年来已孕育出“忍”的性格，不得不“习惯”于此等“安排”。
章孝严、章孝慈在知道了他们生身父母的情形之后，也十分敏感，特别忌讳外界追根究底。章孝严进入台湾国民党外交界后，一直隐瞒着身世。据说，有一次一个外国记者在公众场合不知深浅，冒失相询他父亲是谁，章孝严当时就勃然作色：“今天是来谈国家大事，不是私事。”为了减少麻烦，避人耳目，他与“华航”空中小姐黄美伦的婚礼，就安排在当时比利时的任上，而没有回台湾筹办。时任台湾驻比利时“大使”的陈雄飞，暗中听人说章孝严“来头不小”，为了查证传言虚实，曾特意向台湾西德代表戴安国求证，但为戴安国所断然否认。
陈雄飞为求慎重，又请示台湾国民党“外交部”，不久“外交部”官员王之珍去专函证实此事，但同时希望陈雄飞“淡化处理”，不宜过度渲染，陈雄飞最后决定不去参加章孝严的婚礼。1974年至1977年，章孝严在台湾“驻美大使馆”工作期间，当时的驻美“大使”沈剑虹，亦不明了章孝严的身世。1975年4月，蒋介石去世，章孝严特地请假返台，沈剑虹尚不以为然。直到后来有人告诉他，章孝严是返台“奔丧”时，他才知道这位“小秘书”背景不简单。
1949年国民党政权败亡台湾之时，有不少蒋经国“新赣南”时代的部属，包括一些当年赤硃岭“青干班”的学生，追随而至，后来都受荫于蒋经国而日渐发达，官居要津。对于蒋经国、章亚若的那笔“风流债”以及章孝严、章孝慈两个私生子的情况，他们都心中有数。他们都曾希望蒋经国能为自己的所作所为负责，公开确认自己的血亲之子，既可尽享天伦之乐，同时也算对死去的章亚若有个交待！然而，由于蒋经国一直不表态，任何人也就不敢出声，只能“体谅”“为尊者”的苦衷！
1975年，蒋介石去世，蒋经国成为台湾实际上的最高统治者。当时，不少人曾幻想这段“隐情”可以大白于天下，章孝严、章孝慈可以名正言顺地认祖归宗了！不期然，蒋经国对此仍是顾忌重重，并没有任何明确的说法。直到1987年，蒋经国重病缠身，昏迷中不断呼唤章亚若的名字，道出心中的隐衷后，才在王升的秘密安排之下，有了与章孝严、章孝慈兄弟俩之间自大陆迁台后的第一次私下见面，父子相认。但是对外界，蒋经国自始至终未曾公开确认这一层关系。1988年蒋经国溘然去世之时，章孝严、章孝慈亦未有“孝子”之名，而可以参加到蒋氏家祭的行列中去。他们永远丧失了在父亲有生之年认祖归宗的机会！
蒋经国逝世后，继任者李登辉率先公开承认章孝严、章孝慈蒋家后代的地位与身份，继之台湾的新闻媒介纷纷披露了他们的身世内幕。为了澄清外界传言的种种不实之处，章孝严、章孝慈兄弟俩商量之后，由章孝严于1988年4月接受台湾《远见》杂志记者采访，首次将他们极具戏剧化的身世和复杂曲折的经历公诸于众。
在接受采访中，章孝严追述了童年、少年、青年时代求学生涯中的种种艰辛，追述了通过自身苦斗跻身“硬碰硬”的外交界之后的种种机遇。他反复强调：“我过去的一切并不是像外面所说的、所认为的、所假设的那样，受到安排或特别照顾。”“提到那个关系，我一直到今天都不愿意公开说明。过去我也没有跟任何人说过。”
当然，章孝严也没有回避早年因身世不明而无父母依傍的无尽感伤，他特别感激抚育他们长大成人，并教会他们自强自立的外婆周锦华。接受采访的最后，章孝严着意谈了他与章孝慈之何不寻常的兄弟情分：
我想很少有兄弟有我和孝慈之间这么深厚的感情，也许是因为我和弟弟是双生，小时候很少分开的缘故。小时候我们彼此也有争执，甚至打过架，但都一下子过去就算了。遇到困难我们都相互协助、彼此鼓励。我们虽然没有心电感应，但心意相通，彼此了解对方在想什么。我们在个性上不怎么相同，我可能比较外向一点，他可能比我安静一点，这也是为什么他走学术道路的原因。我很高兴他在学术上有那么好的发展，我也曾经考虑走学术，但觉得既然在外交界服务，就要全心投入，所以在学术上就不像弟弟那样刻意追求。现在我和弟弟彼此都忙，见面的时间不多，但再忙总会通个电话。彼此的联系相当密切，感情也是相当深厚的。
1993年8月底，章孝严又一次在台湾电视上公开露面谈及身世问题。这次与以往不同，他不再讳言父亲蒋经国和母亲章亚若，坦然相陈对他们的思念之情。对于是否认祖归宗的问题，章孝严也没有回避，但表达得十分含蓄和委婉：姓章还是姓蒋，“这件事不能说不重要”，但是他是“父亲的儿子，也是母亲的儿子”。“我认为我姓章，也是我母亲的光荣”。
关于章孝严、章孝慈两兄弟何时认祖归宗的问题，一段时间曾颇引人注目，而最热心此事的当数曾亲眼见证蒋经国、章亚若恋情的“国舅”王升。据台湾媒体披露，章孝慈的丧礼，蒋家只有蒋纬国一人露面。对于章氏兄弟和蒋经国之间的事，他说：“孝严、孝慈的事我一直都知道，但这件事不要严重化，让自然归于自然，很多事情不要讲，有感情的交流就可以了。”他意有所指的是，很多事是很美好的，不要去污染他，就人情来说，还是不说为妙。
蒋经国的三儿子蒋孝勇对章氏兄弟认祖归宗一事一向反对，而主要原因就是，母亲蒋方良依然健在且对此事浑然不知。老太太晚境凄苦，做儿子的不愿母亲再遭打击。随着章孝慈的去世，章氏兄弟是否已到认祖归宗的时机？蒋纬国对此只表示，决定在章孝严本人，我不好做任何事。王升则指出，蒋经国曾提过章氏兄弟应该认祖归宗，但不能操之过急，至于两兄弟则从来没有提出正式的要求。
现如今，章孝严、章孝慈兄弟二人都已是儿女成群。章孝严娶妻黄美伦，育有长女章惠兰、次女章惠芸和儿子章万安；章孝慈娶妻赵申德，育有儿子章劲松、女儿章友菊。
1989年，大陆为其母亲章亚若修墓。1993年，章孝慈回乡为其母扫墓。1994年章孝慈在大陆突发急病，章孝严来大陆探望，并回桂林扫墓，1996年章孝慈去世。
