房玄龄蛰伏蹉跎于上郡，翌年夫人生产，果然是个男孩，便起名叫遗直。身边有了妻儿相慰，黑水寺中有个孤悬法师可以时常聊聊天儿，滏阳县又有了个杜如晦常以书信往来，房玄龄倒也未觉出多少烦闷。时光悄然流逝，塬上草木枯荣，唯有一颗雄心，永远不泯。
大业五年（609），与房家交厚的薛道衡因谈论时政被小人告讦，隋炀帝下令将其缢死。临刑前，隋炀帝冷嘲薛道衡：“朕知道你是一代文宗，现在你一只脚已迈上奈何桥了，不知还能作‘空梁落燕泥否？”
消息传到上郡，房玄龄不禁痛哭失声，其父母也几日茶饭不思。后来听说，是房彦谦去给薛大人收的尸。
隋炀帝改洛阳为东都以后，全国实行均郡县田。因害怕人民起义，朝廷下令禁止打造和私藏铁叉、搭钩、刀刃之类兵器。三月，隋炀帝西巡；五月，派四路大军围攻吐谷浑，收降男女十余万口。六月，隋炀帝至张掖，高昌国王曲伯雅及伊吾吐屯设等都得到厚赂，于是相率朝见，隋炀帝将吐屯设所献的土地分辟为西海等四个郡，迁内地囚犯前来屯垦戍边，以通西域之路。
至此，隋朝据有天下一百九十个郡，一千二百五十五个县，是为大隋王朝的极盛时期。也正因为国力的强盛，使得隋炀帝野心越发膨胀，竟不顾民怨沸腾，又发兵攻打高丽。岂不知这一疯狂扩张的举动竟成为导火索，不久便引燃了全国人民奋起反抗残酷暴政的熊熊烈火，得意忘形的隋炀帝从此步入了自我灭亡的穷途末路。
从大业七年（611）夏季开始，暴乱纷纷，狼烟四起。先有山东邹平义士王薄自号知世郎，组织农民武装起义，占据长白山（今山东章丘东）。紧接着，又有平原农民刘霸道自号阿舅，聚众占据豆子坑（今山东阳信东）；漳南农民孙安祖自号将军，占据高鸡泊（今山东恩县西北）；修县人高士达自号东海公，占据清河，以窦建德为司兵。又有夏津人张金称占据河曲，河间格谦号燕王，渤海孙宣雅号齐王，东都法曹韦城翟让与单雄信、徐世勣等人占据瓦岗寨，外黄王当仁、济阳王伯当、雍丘李公逸、韦城周文举，以及众多不知名号者纷纷起义。其中最有势力的要数翟让等人领导的瓦岗寨一支。瓦岗寨义军多为渔猎好手，善用长枪。他们截取运河中的官商船运，夺得资粮以召天下英杰，附近小股义军纷纷来投，逐渐形成了一支具有较大规模的农民武装。
这年年底，房玄龄又收到杜如晦来信，说他实在不堪县衙里的污浊，弃官回家了。信中说：“当今朝廷腐败，为官者即为帮凶。我等既不能治国平天下，不如退隐以求完节。”
房玄龄见信后十分感动，遂对夫人说：“克明要比我有骨气啊！他淡泊功名，不肯同流合污，我则更多的是隐忍，实际上就是妥协，不如他当机立断。”
从此，房玄龄也便生出辞官归隐的念头，只是一时还找不到合适的机会。况且，他也不愿意让父母感到失望。
