一般认为，泌尿系结石的形成与自然环境、遗传、机体代谢异常、营养状况以及饮食习惯等因素有关。实验证明，饮食中高蛋白、高热量、低纤维素能促使上尿路结石的形成，而现在的家长往往会给孩子食用大量的此类食物，如牛奶、巧克力等。此外，相对高温环境，小孩活动减少以及饮水减少也是泌尿系结石形成的相关因素。
尿液中形成结石的物质如钙、草酸、尿酸等物质排出量增加是形成肾结石诸因素中最重要的因素。肾结石可分为含钙肾结石、尿酸结石、感染性结石等，含钙肾结石又以草酸钙和磷酸钙为主，约占全部尿路结石的90%。
孩子长期服用或短期大量地服用钙剂和维生素D制剂使肠道吸收的钙增多，血钙浓度升高，机体为了维持正常的血钙浓度，从尿中排出的钙就会增多。当过量的钙剂和含草酸盐、磷酸盐较多的食物如番茄、菠菜、芹菜、草莓、甜菜、巧克力、豆制品等一起进入人体时，会导致尿中碱性磷酸盐等增多，增加了出现结石的风险。一旦泌尿系发生感染，多余的钙剂难以排出，发生泌尿系结石的可能性就更大。
