崇祯三年，1630年五月初，姚小三穿着半荷兰人半海盗的衣着，看着大员的农民种殖着蔗糖，这些在大员的农民，都是在崇祯元年，也就是1628年，福建再次遭到大旱时，饥民数量非常多时。郑芝龙在熊文灿支持下，再度招纳漳、泉灾民数万人，定下“人给银三两，三人给牛一头”，用海船运到大员垦荒定居。在大员历史上，郑芝龙是组织大规模移民的第一人，他的这个功劳，也为天阀军在收复大员上打下了坚实的基础。
在现今台南市永*康区一带，姚小三在经过仔细观察，发现了一个叫郭怀一的人，从事垦殖。当时汉人在永*康地区种植麻、米等经济作物，亦发展成交易小村落，即油车行村，郭怀一为当地领袖，荷兰文献作「五官怀一」(Gouqua Faet)。因为普特曼斯当政后，为扭转荷兰东印度公司的亏损，且又因为多次与天阀军打扙，打了败扙，当然要赔钱，这些钱如何来，荷兰人只有不断的增加课税，终於引起汉人不满。
在汉人里，郭怀一就是其中一个有明显反抗情绪的人，在姚小三查了下郭怀一，发现郭怀一曾是郑芝龙的部将。因为天阀军对郑氏产业的呑并，姚小三并无把握控制命令他，只好安排人员挑拨，郭怀一在姚小三的精心安排下，便想密谋起事。
不单是汉人，就连原住民也有不满情绪，特别是麻豆溪事件发生后，先说下麻豆溪事件，麻豆溪事件是一起发生于崇祯二年，1629年，第三任台湾长官彼得·奴易兹派遣62名荷兰士兵深入麻豆社搜捕“汉人海盗”，但麻豆原住民由于对荷兰殖民者杀害他们同胞、要求献地，并且强迫当地青少年服劳役早有不满，但又不得不屈服于荷兰殖民者的武力，因此原住民一边假装协助，但另一方面却运用对当地地理的认识，使荷兰士兵毫无所获。一日黄昏，62名荷兰士兵结束搜索行动，归途时经过麻豆溪，陪伴搜索的原住民便替士兵们拿枪，并背着他们帮助渡河，荷兵不疑有他，到了半途，所有的原住民忽然蹲下，将身上的荷兵推入水中，并顺势将他们强压按下吃水，所有的荷兰士兵全数淹死。
长官奴易兹闻此惨剧大为镇怒，但因滨田弥兵卫事件缠身，说到麻豆溪事件，又当然要说下滨田弥兵事件：在荷兰人占领台湾之前，汉人与日本人就在台湾从事走私贸易。荷兰人占领台湾之后，日本商人与荷兰商人在台湾竞逐汉人货物，因此存在着相当大的利害冲突。1625年起，荷兰统治当局开始向来台湾的日本商人课征一成的货物输出税，但因为日本人较荷兰人早来台从事贸易活动，且此时荷兰货物输入日本享有免税优惠，因此日本人拒绝向荷兰人纳税，双方因此发生纠纷。同年，日本人所购得的一批生丝，因拒绝纳税而遭荷兰统治当局没收，双方关系更形恶化。
在1626年，日本人滨田弥兵卫带领船只到台湾买生丝，并欲向荷兰当局借用帆船到福建运回货物，但均遭到荷兰当局拒绝。是时滨田弥兵卫知悉新港社原住民不堪荷兰当局的虐待，对荷兰心生不满，因此在1627年引诱该社十六名原住民回到日本，准备鼓励江户幕府采取反荷作为。
当1628年春天时，滨田弥兵卫再度率船来台，同行者共四百七十名，其中包含先前十六名原住民。此时的荷兰台湾长官为彼得·奴易兹（Pieter Nuyts），他在滨田抵台前获密报日船载有士兵及大炮、刀枪等武器，因此在日船抵台之际派员登船检查，果然搜出大量武器及火药，因此荷兰当局便将武器及火药全数扣留，并软禁滨田将近一周，十六名原住民遭到下狱。之后滨田提出发还武器及火药、释放十六名原住民、提供船只赴福建取货、准其回日本等要求，但均为荷兰当局拒绝。滨田因此采取暴力措施，率领数十名日本人闯入彼得·奴易兹住处，挟持彼得·奴易兹及其儿子。后经双方协商，以彼得·奴易兹之子为人质，随同滨田返抵日本。
日本方面在滨田返抵日本后，将彼得·奴易兹之子及荷兰船员下狱，并封闭荷兰在平户的商馆。荷兰虽数度向日本交涉恢复通商事宜，但都未成功。巴达维亚方面感到事态严重，在1629年将彼得·奴易兹撤职，并宣判其两年徒刑（直到1632年，荷兰将彼得·奴易兹引渡至日本监禁，荷兰人在日本的贸易才获得恢复)。
因为滨弥兵事件因对麻豆溪事件处理而耽搁下来。及至普特曼斯继任大员总督之后，由于先前的与天阀军海战多次失利，九死一生的刘香不满荷兰人又与天阀军修好（普特曼斯被打怕了，第一次修好后还鼓动弗郎机，也就是西班牙、葡萄牙人来打天阀军，将荷兰战舰杂入其中，又被多次打败，最终不得不真正修好，因为弗郎机赔钱赔款，也要荷军出，如果不出，弗方代表就要到天阀军委员会告密，所以他不得不出钱，但是他现在没钱赔了），并宣告海域，多次劫持荷兰商船。注：弗郎机明清之时无法区分，这里都代指西班牙、葡萄牙人。
抓狂的普特曼斯见天阀军在多次胜利后并没有占领大员，便放下心来。在崇祯三年，1630年五月十七日，普特曼斯亲率1500名荷兰部队及2000名新港社原住民攻打麻豆社，在普特曼斯的命令下，荷兰士兵见人就杀，第一天杀死麻豆社原住民战士260名。普特曼斯并下命令烧毁所有住家，计有三千余户房子全毁。及至六月一日，麻豆社终于向荷兰人投降，并表示他们愿完成接受荷兰政府统治。
之后普特曼斯想借由此次成功的军事行动，东征西讨，最后迫使萧垅社、大目降（今新化镇）、贝加溜湾（今安定乡）、哆啰国（今东山乡）和小琉球等社投降。原住民虽然投降，但仍未完全顺服，普特曼斯开始利用传教士宣传汉人的坏处，用于分化原住民和汉人。就在普特曼斯想要抽出手来对付刘香时（因对天阀军的意见不一，两者翻脸）。
刘香却比他的脚步还要快，在1630年五月十九日清晨天亮前，利用月亮被遮住，以部众六百多人袭击大员（今台南安平）的荷兰人城堡热兰遮城，并且已经用云梯爬上了城墙。被荷兰哨兵发觉，经开枪和炮轰后，刘香率部众逃散而去。数天后，这支海盗从高雄离开台湾，5月20日与天阀军在金门外洋遭遇，李旦之子李国助倒戈投降天阀军，刘香再次战败。
崇祯三年，1630年下五月二十三日，郭怀一邀请附近村庄的好友和村长，到家里商讨举行起义，驱逐荷兰人的事。他们计划在六月六日，也就芒种丰收日之后中元节的晚上，由郭怀一邀请荷兰官吏赴宴，乘机在席间杀死他们。然后，假装护送荷兰长官回去，骗开城门，一举捣毁侵略者的巢穴热兰遮城。
但是，郭怀一没有想到，他的弟弟郭保宇成了出卖他的叛徒，想将他们的起义计划报告给荷兰长官，郭保宇还没行到路上多久，就突然给姚小三拦住，姚小三道：“哦！是郭兄弟啊！真不巧，我是提如阿姆长官的翻译官，你上次见过我吧！”
郭保宇细看，果然就是姚山姆翻译官，知道这人很是得提如阿姆长官的宠幸，因为听说这人曾经是郑芝龙的下属，在郑失势后，劫夺了二艘天阀军的大型商船献给了提如阿姆，并希望得到他的赐名，而且还亲自策划多次劫夺过艘天阀军商船，虽然能成功机率很底，但他已经用行动证明了他对荷兰人的忠心，是条不折不扣的哈巴狗。
郭保宇立马摇着尾巴，对着姚山姆大献殷勤，说道：“山姆长官，我有大事要报告提如阿姆大人。”
姚山姆，也就是姚小三，对着旁边的下属道：“他说他有要事要报告大人，你们觉得大人有空见闲杂人等吗？”说完左手整了整海盗帽，右手上做了个钱的手势。
郭保宇一看，马上掏出几两碎银，就要往姚小三的右手上放，不知是不是姚小三手抖，一时没接住，银子掉了一地。郭保宇一呆，便忙下跪去检，其中一粒银子正好在姚小三的随从脚边，姚小三回头眼色示意间，那随从抬脚重重的踩到郭保宇的捡银子的手上。
郭保宇惨叫连连，姚小三细声细气道：“就这点银子，就想打发掉本官吗？”
郭保宇忍着泪水道：“山姆长官，等我报告了大人，就会领到很多的银子，到时我再分给长官。”
姚小三笑了笑：“哦！本官这么可怜啊！要你分银子给本官。”
郭保宇想将那随从的脚移开，但却发现那脚粗状有力，根本动不了，越动踩的越痛，哭道：“长官，长官，我的手。”只好道：“是长官领到银子，分给我。”
那随从看到姚小三的示意，收了脚，郭保宇抖着充有死血的手，心下大恨，可是人家是红夷当红的红人，当下只能忍气吞声。
姚小三轻轻踢了踢郭保宇身子，道：“有什么大事能让大长官给本官银子阿！”
郭保宇忍着手痛道：“长官，郭怀一想要造反。”说完便将郭怀一商定的事说了一篇。
姚小三奇道：“有这等事，可是本官听说，这郭保长可是你的亲兄弟。”
郭保宇道：“长官，是的，这郭怀一大逆不道，我只好大义灭亲。”
姚小三点点头道：“走吧！和本官一起去找你兄长问问，他是不是想造反，如果是，再报告给长官不迟。”
郭保宇奇怪道：“可是，郭怀一集合了几千人，只怕……
姚小三点点头，道：“哦！原来如此，你怕我们去了就回不来了，可是你觉得我是蠢货吗？死汉奸！”
郭保宇一听，良久才反应过来，全身不住颤抖。
姚小三命部属秘密将郭保宇给架回去，郭怀一见亲弟弟竟然敢背叛自己，心下大痛，当场抽刀亲手将其斩杀，他伤心是没想到亲弟弟竟会出卖自己，还在眼泪直留就与姚小三部属立定攻守盟约，并答应不将姚小三的身份告诉任何人。
姚小三很是无奈，郭怀一起事的，不单郭怀一的亲兄弟想告密，他的结拜兄弟也想告密，要不是他布局充分，郭怀一就惨了，到了中元节的晚上，一却按计划进行，由郭怀一邀请荷兰官吏赴宴，乘机在席间杀死他们。然后，假装护送荷兰长官回去，与姚小三里应外合打开热兰遮城外城门。隐藏在暗处的天阀军地下部队也顺应攻入热兰遮外城内。而早得到消息的天阀军海军三个师，则提前几天出港，配合陆军二师和原住民势力收复大员各地，同时驱逐攻打西班牙人，包围沪尾鸡笼的圣多民哥城和圣萨尔瓦多城（均为西班牙人占）。
当西班牙在天阀军的强大机枪和火炮攻势，已经宣布下投降时。
而在热兰遮城的荷兰人，在外城被攻破的情况下，还借火器之利，配合密特堡、亚尔模典堡、坎贝尔费堡、佛力欣廉堡，死死的守卫着内城，并和赤嵌城对天阀军地下党（情报局的一个部门）形成对待威胁。
因为地下党成员没有配有机枪，只有炸药包和冷兵器，自然不是对手，当天阀军陆军一师在海师的运送下登岸，火力优势逆转。
在战斗准备工作没做完时，陈子文作为参谋长，写了一封信，让投降的荷兰俘虏送进内城，传达给荷兰殖民头目大员总督普特曼斯，要他投降。信中有这样几句话：“然台湾者，早为中国人所经营，中国之土地也。……今予既来索，则地当归我。”明确地指出中国收复失地是不可磨灭的真理。
然而侵略成性的普特曼斯，仍然企图据险顽抗，李连捷命令大军把赤嵌城严密包围起来，天阀军大炮发炮向城里进攻。赤嵌城附近的原住民都来援助天阀军，送水送粮的不计其数，城里的汉人（被俘虏的美貌军妓和英俊男仆）也给天阀军传递消息，殖民者的命运完全控制在了天阀军的手中了。
热兰遮城在新型的天阀军大炮面前，只支持了二天三夜，敌军官兵（不单有荷兰兵，还有部分汉奸）死伤一千多人。
而赤嵌城更惨，只支持了一天，外墙就破的不行了，天阀军机枪兵根本就没有城墙的阻挡，成功杀入，赤嵌城告破。
面对热兰遮城内城城墙的破败，天阀军强大的远程大炮攻击情况下，普特曼斯黔驴技穷，正想扯起白旗，宣告投降。不料，还没等他下令，无数的天阀军机枪骑兵就杀进长官公署。狙击完几个还想反抗的荷兰士兵后，普特曼斯双手背举，被一名叫温细弟的猎鹰队狙击手给按倒跪在地上。
李连捷作为本次的战斗总指挥，和陈子文一同坐在了给大炮轰的不成样的长官公署，当众审问普特曼斯时（这房间还倒了一面石墙，可见战争的激烈程度），意畏着台湾光复。
