唐王隆武元年（一六四五）八月，幸大学。乙酉，颁祖训五十七条于阁部科道，大学士林欲楫率诸臣表谢。庚寅，命肃卤伯黄斌卿出镇舟山。命吴江诸生孙文中赍手敕召路振飞；及其至，拜太子太保、吏兵二部尚书、文渊阁大学士，官其子太平为兵部员外郎。壬辰，册曾妃为后，赠后父曾文彦为吉水伯。癸巳，行郊天礼于南郊，芝龙、鸿逵称疾不从，户部尚书何楷劾其无人臣礼，宜正厥罪；王喜楷敢言，命掌都察院事。命妇朝后于太和殿。邵武知府吴炆炜、推官朱健闻敌畏葸，弃城先逃，下狱诛。靖江王嘉亨僭号桂林，执巡抚瞿式耜幽之，两广总督丁魁楚遣总兵陈邦传往攻；封魁楚平粤伯，加式耜兵部侍郎。式耜得释，即令中军焦琏合邦传兵擒之，械送福州。行保甲法于天兴府。定锦衣卫军制，设中前后五所，每军百户曰一威所，八威所为一禁军。时兵事皆掌于郑氏，芝龙自知众论不平，不出关无以弭众，乃请以鸿逵为大元帅出浙东、彩为副元帅出江西；各拥兵数千，号数万。既出关，托候饷，仍驻不行。鸿逵驻仙阳镇，虑有上书言事者，严禁仙霞关不听四方儒人入。王檄催孔亟，不应。彩行百里而还，称饷缺，留如故。
九月，清兵取徽州。时李自成兵败，走九宫山，为村民鉏击以死，楚督何腾蛟以闻。其众无所归，推其兄子李锦为主，同自成后妻高氏、高弟一功等乞降；腾蛟与摄抚堵胤锡往受之，一时增兵数十万。王大喜告庙，进腾蛟大学士，封定兴伯；胤锡右副都御史，实授湖北巡抚，总制其军。降将皆授总兵官；赐李锦名赤心、一功名必正，高氏为贞义夫人，号其营为忠贞营。已而粮不继，降者稍稍散去。高氏十三部就食施州卫，其余郝摇旗、马进忠、王进才、张光翠、袁应第、牛万才、张先璧等十余营悉隶腾蛟麾下，军势颇振。然王内制于郑氏，不能出关相应援也（以上南疆绎史、榕城纪闻）。
十月，科臣刘中藻颁谕浙东鲁王，不受，张国维、熊汝霖等拒之也；自是闽、浙相水火矣。鲁行人张煌言自请使闽，从之。原任兵部侍中王期升、御史彭遇颽至行在，加期升总督衔、遇颽佥都御史。大学士路振飞、曾樱封还内传，谓遇颽依附马士英，期升在太湖奉朱盛征称通城王，派饷苛虐，不可用；王乃止。杨廷麟疏至，请王幸江右；何腾蛟请驻湖南，浙中诸将请如衢州。王以芝龙不足恃，欲出赣入楚倚腾蛟。会原任临清知州金堡朝行在，言腾蛟可倚，急宜弃闽幸楚；王大喜，即擢堡兵科给事中，决计由赣以赴长沙。遣大学士苏观生诣南安募兵。户部尚书何楷请告去。相传楷与芝龙不合去，至大田驿，忽夜数十人排户擒殴，去其左耳，未几死之（南疆绎史、小腆纪年、海东逸史、榕城纪闻）。
十一月甲午，类于上帝，以钓龙台为天坛。乙未，禋于太庙。丙午，禡于社稷。丁巳，以郑鸿逵为御营左先锋出浙江、郑彩为御营右先锋出江西，驾幸西郊行推毂礼。先期为坛，设先帝高皇帝位。王御翼善冠诣坛所，百官陪位，武臣戎服听事。王皮弁升坛拜谒，立于神位西、南面，御营先锋北西跪，兵部授钺，王东向揖之。赐饯，光禄寺授爵，御营先锋跪受爵。诫劳毕，谢恩出，率将士跪坛下。王甲冑誓师，乃鸣金鼓扬旌而出。当授钺时，风雨晦冥，大风陡起，坛上烛尽灭，神位皆仆；鸿逵出城，马蹶踣地，
者以为不祥。下诏亲行，以唐王聿钊、邓王鼎器监国，大学士曾樱协同芝龙留守。以吴震文为随营兵部侍郎、王觐光为随营户部侍郎，皆兼吏户礼三部事；张家玉、陈履贞为随营兵科，亦兼吏户礼三科事。命曹学佺修思宗实录，设兰台馆以处之（同上）。
清授张存仁浙江福建总督（贰臣传）。
十二月甲申，王戎服登舟，大学士何吾驺等随行。舟次芋江，五溪百姓壶浆迎者载道，皆赉以银牌。清佟养和、金声桓进剿福建，分兵攻南赣，败永宁王、罗川王、阁部黄道周等。壬寅，道周师至婺源溃，被执。南赣巡抚刘同升卒，命万元吉兼摄其事（南疆绎史、清世祖实录）。
是年，清遣内院洪承畴招抚江南、御史黄熙胤招抚福建，皆芝龙乡人（三藩纪事本末）。
二年（一六四六）正月己酉朔，唐王在建宁，不受朝贺，以三大罪自责，令百官皆戴罪从行。交趾、日本国皆遣使入贡。广东布政使汤来贺运饷十万由海道至，擢来贺户部右侍郎。马士英叩关求入朝，王数其罪，谕守关将士勿纳；士英七疏自理，终不许。鲁监国遣柯夏卿、曹维才来聘，王加夏卿兵部尚书、维才光禄寺少卿，手敕谓：『朕无子，王为皇太侄，同心戮力，共拜孝陵。朕有祚士，终致于王。取浙东所用职官，同列朝籍，不分彼此』。寻遣佥都御史陆清源解饷十万犒浙东江防诸军，而浙中相传闽遣黄鸣骏来科浙中八府粮，盖士英、阮大铖构之也。方国安纵兵夺饷，杀清源（案系三月事），而闽、浙衅益深矣。熊开元罢，以苏观生兼吏兵二部尚书行在文渊阁大学士，出为经略，赐上方剑便宜行事；王御门，赐银印日「瞻奉南北山陵安集军民文武官」。召见泉州方士蔡鼎，授为军师（南疆绎史、海东逸史、小腆纪年）。
二月，马胫岭兵变，命路振飞至浦城安抚之。江楚迎王疏相继至。诏宽逆案之禁，王曰：『北京陷于东林、南都亡于魏党，厥罪维均。今中兴之初，嘉运綦新，附党诸臣，概予洗濯，以收后效』。擢堵胤锡右副都御史，巡抚湖广。丁亥，大雨雹，风霾昼黑，对面不相见。广西有僧自称弘光，召九乡科道议将迎请，廷臣曰：『即真弘光，甫经失国，有尊奉而无迎请』。已而有司审知其伪，下狱诛之。嘉亨俘至，下诸王议，废为庶人，以幽死；诛其臣顾奕、吴之琮、杨国威、张龙翼等（同上）。
太子少保、户部尚书、文渊阁大学士蒋德璟罢（残明宰相年表）。
柱国少保、吏部尚书兼文渊阁大学士路振飞赴浦城安抚兵变；七月督师安关，八月走泉州（同上）。
三月戊申朔，督师大学士黄道周殉节南京；王闻恸哭，辍朝，赠文明伯。王将出汀入赣，与湖南为声援；芝龙使军民数万人遮道号呼，拥驾不得行。芝龙因具表请回天兴，王不得已驻札延平。封成功为忠孝伯，挂招讨大将军印。以张肯堂为留守，旋加少保，总制浙直，给敕印便宜从事。辛未，清兵破吉安，郑彩弃广信，奔入关。
四月五日万寿节，不受贺。未几，抚州亦破。命礼臣追复建文年号，立方孝孺祠。先是，汀邵间有大帽山峒蛮最强，屡征不服，益宗永宁王慈炎诱之出降，以与清兵战屡捷，遂复抚州；清兵围之。郑彩屯广信府，永宁王请救；其监军给事中张家玉以三营往援，围暂解。已而复合，彩军溃，抚州遂破；永宁王死之，峒峦亦散。报至，举朝震惊，命削彩职，戴罪图功。廷麟、元吉退守赣州，清兵追攻之。
五月竞渡，郑芝龙率标营官军于西湖斗舟，旗帜皆写「钦命藩王」等目。
琉球国入贡。廷试贡生，取万刑等十二人，命为萃士，照庶吉士例送翰林院教习。擢湖广监军道章旷为右佥都御史，巡抚湖北。鲁监国遣都督陈谦入闽，久驻衢州持两端，自云鲁已爵为侯，却邀封。召赴行在，御史钱邦芑劾其外媾，下狱，将杀之。芝龙与谦有旧，亟入朝，请以官赎谦死；王故留芝龙久语，密促行刑。芝龙出，已死矣，因厚殓之；由是益怀异志。加吏部尚书郭维经六省督师衔，募兵援赣。赣已被围两月，巡抚刘广胤战败受执，援兵皆不敢前。
六月，开科取士。命广额七十名，流寓者皆入试。以编修刘以修、闵肃为主考，举叶琐等一百七十五名。士子多以贿进，乃命于至公堂覆试，落四名；逮同考推官王三俊下狱，追赃一万两。浙东报至，清兵已渡江取绍兴，鲁监国航海去，江上诸师尽溃。鸿逵驻城外，闻报，乃徒跣而逃，三日抵浦城。事闻，行在大震，削其封爵（以上南疆绎史、小腆纪年、榕城纪闻）。
鲁王航海入闽，十二月次中左所，寻改次长垣。
兵部尚书东阁大学士田仰奔闽，封海忠伯；寻迎降。
兵部尚书兼东阁大学士督师防江熊汝霖随扈鲁王入闽（以上残明宰辅年表）。
七月，元子生，大赦；加恩从兴诸臣，悉进爵。御史钱邦芑言：『浙东新破，唇亡齿寒，举朝正切同仇之日，非蒙恩受赏时也』。不报。己已，王御门，内侍捧小匣置御前，诏谕群臣曰：『朕本无利天下心，以勋辅拥戴，不得已勉徇群策，浣衣粝食，有何人君之乐？干夕干惕，恐负重付。岂意诸臣已变初志！昨巡闽之使，得尔等出关迎降书二百余封，今俱在此。朕不欲知其姓名也，今命锦衣卫焚之午门前。尔诸臣其有名者，尚洗心涤虑否？倘能竭节奉公，不渝终始，是所望也』！王长身丰颐，声如洪钟，闻者悚息。时决计幸赣，芝龙百计阻之，欲留王以自重；既而阴通款于洪承畴，托言海寇至，驰还临安，尽撤关隘，水陆诸兵随之去。清兵既破浙东，长驱而前，仙霞岭空无一卒，遂如入无人之境焉。何腾蚊遣郝永忠以铁骑五千迎驾，将至韶州，清兵已出衢州矣。初，杨文骢走处州，唐王与之有旧，拜为兵部侍郎，提督军务；至是援衢，清兵至，不能御，为追骑所获，不降，戮死（南疆绎史、通鉴辑览）。
八月甲申，清兵克建宁，明兵备佥事倪懋熹死之（小腆纪年）。
甲午，王启行。监军钱邦芑先期请清路，犹赫赫颐指属县。乙未，驾至行宫，戎冠金蟒而入。上好书，虽崎岖军旅，犹载书数十车以从。丁酉，上抵顺昌，昧爽未发，至巳刻，一时排闼，云清兵已及剑津，毁关，且踵至。顷之，行宫数骑突出，云驾已在内，从行者惟何吾驺、郭维经、朱继祚。已而何与郭亦散去。曾后肩舆河干，顾从官曰：『刘宫人有怀，好护持就道』；辞旨慷慨。妃媵狂奔，有一舸而数人者，有一骑而三人者。先是清兵抵仙霞关，守浦城巡按御史郑为虹纵民出走，自守空城，与治饷兵科给事黄大鹏、延平知府王士和并被执，死之。至是，王自延平出奔。庚子，入汀州城。辛丑，清兵奄至，有叩城称扈跸者；开丽春门纳之，则追者八十三骑也。守门百户闵时死之，骑直入行宫，从官迸散，乃执王与曾妃去。总兵福清伯周之藩战死。妃至九龙潭投水死，沈嫔、陈嫔及内官死者十余人。王死于福州（三藩纪事本末、小腆纪年作王与曾妃同斩于汀州之府堂）。其殉难之臣有唐王聿钊与弟聿囗〈金粤〉、部郎赖垓、给事中熊纬、御营总兵胡上琛、定远侯邓文昌等。或曰代死者为张致远，王实未死；后郑成功兵屯鼓浪屿，有遣使存问诸臣者云为僧于五指山，然亦莫必其真伪也。是冬十月，赣州闻王讣，全城气索。会天雾雨雪，城夜破，督师大学士兵部尚书杨廷麟、户部尚书姜一洪、兵部侍郎左副都御史江广总督万元吉俱赴水死，吏部尚书郭维经、御史姚奇胤入嵯峨寺****死，湖西兵备佥事太常卿彭期生自缢死，兵部职方主事周瑚被执不屈戮之，右都御史杨文荐擒至南昌绝粒死，翰林院编修徐复仪投崖死。后闻难继死者：尚书曹学佺、通政使马思礼等皆自缢，御史艾南英缢于汀州僧舍，大学士蒋德璟于九月泉州失守不食死。粤中永明王立，遥上尊号曰思文皇帝。丁酉春，复谥曰绍宗襄皇帝（闽事纪略、南疆绎史、清白士集、临汀汇考、小腆纪年、恽逊庵遗集）。
时大学士何吾驺走广州，十二月迎降。大学士曾樱、路振飞走居中左所。大学士黄景昉走泉州。大学士朱继祚走兴化。吕大器奔广东。熊开元为僧。太仆寺少卿王瑞枬避山中，有欲荐令出者，自经死。振飞后赴桂王召，卒于途。都督胡献深与其妾衣冠对坐，饮药于私第。有赵昂者不肯薙发，从容刎死于家。先是阮大铖赴江干乞降，从清兵攻仙霞关，僵朴石上死。马士英既降，清兵至顺昌，搜龙扛得士英等请唐王出关己为内应疏，遂斩之延平城下（明纪、残明宰辅年表）。
福建既平，郑芝龙自安平奉表降。其子成功恸哭而谏，芝龙不听。成功与郑鸿逵、郑彩等各率所部入海（明纪）。
金坛人王祈聚众入建宁，属县多响应。清总督陈锦、张存仁、侍郎李率泰统兵六万来围建宁。永明王使揭重熙赴援，至邵武不能进，建宁遂破，王祈力战死（恽逊庵遗集）。
十月，桂王监国肇庆府。十一月即位，以明年为永历元年（小腆纪年以为十一月事）。命太保兵部尚书中极殿大学士陈子壮节制两广、江西、湖广、福建军务（残明宰辅年表、海上见闻录）。
——录自福建通纪卷十。
清世祖顺治四年（明永历元年、鲁监国二年、海上郑成功称隆武三年、一六四七）正月：先是鲁王南奔至石浦，张名振护王航海至舟山，守将王斌卿不纳。王浮海至厦门，复入南澳。郑彩率舟师迎王，王命彩讨杀斌卿，封彩建威侯。提督杨耿、彩弟总兵联皆以兵来会，进彩建国公、名振定西侯，耿同安伯、联定远伯、周瑞闽安伯、周鹤芝平彝伯、阮骏荡湖伯。鹤芝复海口，以参谋林钥舞、总兵赵牧为守。时尚书张肯堂募兵海上，贻书招之。前佥都御史金衢巡抚刘中藻以众来归，授为兵部尚书兼东阁大学士（南疆逸史、小腆纪年、残明宰辅年表）。
鲁以刘中藻督师浙闽。鲁王次闽安镇（残明宰辅年表）。
二月壬申，鲁王兵袭海澄。明日，攻漳州不克，总兵陈国祚战死。又明日，清兵攻海澄，南师退入于海（海东逸史、小腆纪年）。
