李鸿章早就料到为了修铁路的问题，朝廷上和官场上迟早会闹成这么一个混乱局面，可是，他也不甘示弱，决定奋力还击！此时，他所能揪住的最有力武器就是醇亲王奕譞，醇亲王奕譞这些年收了他那么多的贿赂，可不能白收！他在年关临近之前，于光绪十四年十二月二十二日、二十八日（1889年1月23日、29日），两次致函醇亲王奕譞，用翔实的论据、尖锐的言辞，将大学士恩承、吏部尚书徐桐的谬论狠批痛驳，他说，铁路乃是非所在、利害所关，不敢不辩！……铁路系为调整，朝发夕至，屯一路之兵，能抵数路之用。有了铁路，非常之差徭可无虑，南北商旅及附近官民有紧急要务，皆可附搭行走，这是利国利民之大端，并非铁路乃公司之利、非民人之利。……
李鸿章请醇亲王奕譞将他的这两封书函转给大学士恩承、吏部尚书徐桐看，并且转给海军衙门的诸位讨论是否应该罢修铁路的官员公开传看。他还声言说，凡是想讨论是否应该罢修铁路的人，均不妨去看看他的这两封书函，长长见识！--很多人都以为这几句话是李鸿章专门说给户部尚书翁同龢听的，而翁同龢则确实认为这几句话是李鸿章为了跟他过不去才故意传扬出来的。
由于光绪皇帝的大婚典礼将在光绪十五年正月二十七日（1889年2月26日）举行，所以紫禁城皇宫中在光绪十五年正月初一日（1889年1月31日）这一天，还像去年一样，王公贵族、文武百官照样按照大朝仪的规定进宫朝贺，可是宫中却并没有举行盛大的筵宴，只顾了替光绪皇帝的大婚典礼忙碌。宫中的元旦赐宴虽然停了，可是过年期间，王公大臣、文武百官在宫外所举行的各种大小宴会依然照常不误！不过，海军衙门的官员们在忙着酬酢之余，总算还是将对于那些请罢修铁路的奏折的复奏写了出来。
元宵节前一天，光绪十五年正月十四日（1889年2月13日），海军衙门将这份复奏呈递给慈禧太后。这份复奏用非常明确的态度指出，北京城中那些请罢修铁路的大臣官员们所呈递的那些奏折都是些"不察底蕴、不相匡助"的东西，那些人"或道听途说，或凭空结撰，连章论列，上渎天命"。这份复奏将那些人在奏折中所啰唆的铁路之害总结为"资敌"、"扰民"、"夺民生计"三条，并逐条给予驳斥。--对于铁路"资敌"问题，海军衙门的官员们认为，一旦发生战争，为了战时需要，可以拆铁轨、埋地雷，让敌人无法利用铁路，不存在以铁路"资敌"的问题；对于铁路"扰民"的问题，他们认为，修筑铁路时应该力求避免毁坏民间的房屋和坟墓，若万不可免，则应给以重价，许其迁徙，完全可以达到"恤民隐而顺舆情"的目的；对于铁路"夺民生计"的问题，他们认为，修筑铁路不仅不会造成失业问题，反而将增加就业机会，有了铁路之后，修路扫轨、升旗听电、收票验座、运煤添水、搬货物、运行李、卖报纸新闻、贩茶果、伺应住旅店的旅客、巡察货栈……这种种的职业都需要人，不会因为有了铁路而造成更多的失业之民，民众不仅不会因为有了铁路而失业，还会因此得到更多的生计、变得更富裕。--海军衙门的官员们在这份复奏中还建议说，"可否将臣等此奏、并廷臣各原奏发交各该管将军督抚按切时势、各抒所见，再行详议以闻。"
