没错，玄清赐给轩辕的就是屠巫剑，只不过是加入了补天功德，化解剑身的怨念，成为人族的圣器，在人皇手里便能产生巨大的威力。
蚩尤也不害怕，不就是一把武器吗！他还有一把魔刀在手呢。轩辕得剑之后，一跃跳下土坡，和蚩尤战在一起，你劈我一刀，一个横身躲开，反手还你一剑，两个人之间刀光剑影，身形交错，都是拼命招式，蚩尤仗着身体坚硬，力拼轩辕一剑，先要把他斩杀于刀下。
想法是好的，现实是残酷的，轩辕一剑就消掉了蚩尤的手臂，正好还是拿刀的手，两个人都愣住了，轩辕没想到手里的宝剑这么厉害，大巫的身体都能切开，蚩尤脑中一个激灵，对着玄清大怒！
“玄清人祖，你卑鄙无耻，此乃是屠巫剑，根本就不是人族圣剑！”大巫之身虽然刀枪不入，金刚不坏，但一旦受伤就是不是短时间能恢复的。
“屠巫剑是用我百亿人族精血铸炼而成，怎么会不是我人族圣器，你在看看此剑有何不同！”玄清淡淡回答。
不用玄清说，蚩尤都知道不同，以前的屠巫剑他见过，现在这把剑，一面是日月星辰，一面是山河之图，所以才着了道，可问题现在该怎么办，除了一拼没有任何办法。
“有本事就破我这改良的都天大阵吧！哈哈~~~~”说完便回到阵点，启动了天魔阵。
玄清一看此阵明白只是须有图表，对他来说不可一击，但自己又不好出手，便叫孔宣和大鹏前去破阵，在他们耳边叮嘱几个细节，兄弟二人进入大阵，便看到阵中一会五色之光闪过，一会又阴阳二气冲天，不多时大阵破了，蚩尤被当场拿下，押倒在轩辕面前。
轩辕谢过人祖和护法相助之恩，也谢过在场的仙人大德，最后将蚩尤收押起来，派人专门看管。
玄清吩咐孔宣二人继续去悟道，临走的时候看了一眼广成子道“人族不是那么好杀的，他日你必会为此付出代价！”
玉清门下身上一颤，刚才感到一股杀气，使他们汗毛都战栗起来，知道人祖迁怒广成子的作为，几人潺潺的和轩辕告辞，回转玉虚宫去找圣人化解此事。截教门下之人也走了，虽然没有出太大的力，但任务也算是完成了。玄都恭恭敬敬行一个礼，也回八景宫交旨去了。
“轩辕，不管是哪一个部落，只要是人族便是你的子民，不可失了公允，要一视同仁方可，九黎的事情相信你能妥当安排，莫要伤了族人的心！”玄清临走的时候，特意指出善待他族。
这次出来主要帮助轩辕结束这场战斗，没想到还能顺便收下一徒，那便是轩辕的首席乐师伶伦，此子对音乐之道实在是难得，带回山和仓颉作伴正好。
轩辕得胜班师回朝，其他几个部落纷纷前来请罪，因当时看不清形势的发展，故没有派兵相助，等到事态清明的时候，在派兵的时候，大战已经结束了，害怕人皇算账，故前来请罪！
对待蚩尤本是要以正典刑，但凡人之器对他根本无效，叫嚣轩辕拿他没有办法，此事正好传道轩辕的耳朵里，然后将人祖赐给他的宝剑，交于手下斩杀蚩尤。
一看到此剑，蚩尤大骂玄清害他，本以为屠巫剑玄清收回去了，没想到还在人皇手里，一剑下去，蚩尤便头颅落地，可是没等一会，头便飞回去重新长好，此事闹得轩辕不知该如何办。
“陛下，此事好办，只要把蚩尤分尸，派人葬在远处，使他不能合一，不就可解决他不死之题！”风后想到如何处理蚩尤，便禀明轩辕和众位大臣听之。
最后此法果然可行，便将蚩尤分成好几份，四肢葬在天地四极，派人专门看管，并贴上符箓避免蚩尤召唤身体。躯干镇压在地底岩浆旁，利用炎火之力炼化他的身躯，头颅抛掷于大荒山，只剩下头颅的蚩尤，却感应不到其他身躯在哪，如此坚持三个月后，不甘的化作枫树林！
一统人族后轩辕更名为华夏族，意指所有人族是一家，不分彼此，随后感念龙族的贡献，开始以龙的形象绘制图腾，供人开始参拜，还在江河湖海之地，建立龙王祠，请龙神保佑当地人民风调雨顺。
风后在此之后，又为人族创出蛇藩阵、虎翼阵、飞龙阵、地载阵等好几种阵法，交给力牧训练大军，黄帝始重新制定规则管理人族。
划野分疆，八家为一井，三井为一邻，三邻为一朋，三朋为一里，五里为一邑，十邑为都，十都为一师，十师为州，全国共分九州；设官司职，置左右大监，监于万国，设三公、三少、四辅、四史、六相、九德共120个官位管理国家。对各级官员提出“六禁重”，即“声禁重、色禁重、衣禁重、香禁重、味禁重、室禁重”，要求官员节简朴素，反对奢靡。提出以德治国，尤其是设立“九德之臣”，教养百姓九行，对犯罪重者判处流失，罪大恶极者判处斩首等。
重新制定历数，方便人民根据节气播种种地，然后又推展祭祀、婚丧、棺椁、坟墓、祭鼎、祭坛、祠庙、占卜等。人族之事已全部进入正轨。可是轩辕迟迟没能等到自己证道的消息。
思来想去，终于想明白了，伏羲留下了《先天八卦》，神农有《神农本草经》，自己是不是也应当著书，流传后世才可，越想越是此理。
轩辕开始将人族大小事情交给风后等人处理，除非是重大不可的事情，他才会出来处理。天庭派下来的人除了九天玄女，其他人都回去了，九天玄女对玉帝王母的交代是，继续辅佐人皇，好壮大天庭的声望，玉帝王母就同意了，可是没想到日久生情啊！
最后九天玄女还是和轩辕有染，还帮助轩辕著书《黄帝内经》，纸是包不住火的，玉帝听闻此事大怒不已，感觉玄女丢了天庭的颜面，但配嫁人皇也不无可，但私下婚配就不对了。为此，玉帝和王母制定了天条，最严重的就是婚配一事，没想到日后却自食恶果！
轩辕耗费三年的时间，终于创出《黄帝内经》流传后世，此书一出轩辕也就功德圆满。
刑天在知道蚩尤身陨后怒不可以，他也希望巫族能重临洪荒大地，但相助轩辕的不是三教圣人门下，便是深不可测和巫族关系混乱的人祖，最后将恶气撒到昊天身上。
单人匹马杀到凌霄宝殿，昊天刚刚得到消息，还没来的及做准备，刑天已经到门口了。
“刑天，你太胆大妄为了，天庭重地岂是你能私闯的吗？”昊天不愧是天帝，一发怒，便有一股皇者之气！
“昊天，我巫族与你何仇，竟然敢小觑我巫族，是你先和我们作对的，今日便叫你见识一下我巫族的厉害！”
刑天舞动干戚，上去就是一斧子，这斧子可不一般，传闻乃是开天神斧一丁点碎片演化而来。昊天一听，心里那个气啊，好你个刑天，三教这么多人和蚩尤为难，你不去找他们反而找朕！
原来你看我是好欺负的不成，昊天转身抽出宝剑，便和刑天大战在一起。两人从天庭打到地上，来来往往好不精彩，昊天抓住机会，一剑便砍下刑天的头。
刑天头掉而不是，开始摸索头在何处，昊天一挥剑，大山崩裂一道口子，刑天的头颅掉进山缝，接着将山合在一起，轰隆隆的响声，刑天知道在也找不回头了。
一道黑气冲天，然后便看刑天形象大变，以乳为目，以脐为口，大呼：“昊天休走，在战！”
昊天一看吓得脸色煞白，这巫族竟然这么勇猛，慌不择路逃回天庭，刑天因为失去头颅，看昊天逃走也没有在战的兴致。
此战洪荒之人明白了昊天的实力不容小觑，刑天也得到战神的名号，因此还留下一段佳话：刑天舞干戚，猛志固常在。
