双孢菇是一种典型的草腐菌，野生双孢菇往往生长在腐熟的粪草堆上，所以人工栽培双孢菇一般都采用粪草培养基。不过，由于栽培面积的不断扩大，牛粪资源短缺而价格上涨，利用不添加畜禽粪的合成培养基以及其他代用料来栽培双孢菇的也越来越多。
双孢菇生长吸收的营养全部来自于培养料，所以培养料必须能够提供双孢菇生长必需的碳源、氮源、无机盐和生长因子，而且这些营养物质必须具有合适的比例。由这些营养物质配合而成的培养料还必须具有良好的物理特性，最重要的是要具有良好的持水性和透气性。所以，充分了解配方中各种物质的特性，科学地设计配方非常重要。
在栽培料中所占比例较大的原料称为主要原料，简称主料。主料约占培养料总量的90％～95％。栽培双孢菇的主料多为农业生产中的副产物，常用的主料有秸秆、畜禽粪以及各种饼肥，近年来棉籽壳、玉米芯也用作栽培主料。
（1）秸秆。一般作物的秸秆都可使用，如稻草、麦秸、玉米秸、谷壳、玉米芯、棉籽壳等，含碳量较高，但含氮量偏低，主要作用是保持培养料合适的物理性状并提供碳源。秸秆需求量大，应适时收集并妥善贮藏。
（2）粪肥。粪肥是双孢菇生产中需要量仅次于秸秆的主要原料，使用量一般占培养料总量的35%～60％，主要作用是保持培养料合适的物理性状并补充培养料中氮源的不足。粪肥的种类很多，牛、马、猪、羊、鸡、鸭、鹅等动物的粪以及人粪尿都可使用。
（3）饼肥。饼肥是花生饼、豆饼、菜籽饼、棉籽饼等的通称，含氮量较高。饼肥是双孢菇生长的良好氮源，一般添加量为培养料总量的2％～5％。
