在口袋妖怪玩家中流传着一个传说，当你通关第999次时就会发生神奇的事
我们的故事就发生在一个男孩身上。枫痕，他是一个孤儿，7岁时目睹了母亲被杀的场面。从此，他不再相信任何人，没有人关心他，也没有他关心的人。在他10岁的那年，他被一个富商收养，那个人他十分熟悉，没错就是三年前杀死他母亲的人。他便一心策划着复仇的计划。。。。。
狂风呼啸。。空气切割。我们的主角终于第999次通关了，殿堂上登录着他的六只精灵：天恩噩梦小队的核心成员波克基斯，幸福蛋超能斗士之称的艾路雷朵唯一属性弱点的宝石鬼勾魂眼傲娇蛇之称的君主蛇歌神美称的美洛耶塔。他起身将游戏机放到了柜子里，拿起了一把匕首走向了那个人的卧室。“只有那个世界才没有仇恨。”临走前看了一眼宠物小精灵的海报。“下辈子，再见吧”
“为什么，为什么啊”“你杀了我的母亲，我是来复仇的”那个人倒在了血泊中。他环顾四周，回到了自己的房间抱起了皮卡丘的玩偶打开窗户一跃而起。突然天边一到闪电，他消失了
“这里是哪“枫痕揉揉脑袋“悲惨的孩子，我是神，你的命运如此悲惨但决心很想，我选中了你作为我的使者去你最喜欢的世界吧”一个虚幻有貌似熟悉的人影出现。
时光追溯到几天前，他帮助了一个老人避免了他被车撞。而这个老人就是神。
“我会将你殿堂里的精灵以初始形态不同方式送给你，mega石也会给你。我将阿尔宙斯的一小部分妖精石板力量赐予你，去拯救那个世界吧，会有更多人关心你的，你不会孤独！”
白光闪过，他消失了三年后，“小枫，好久不见，我来看你了。”“哥哥啊。”“要不要这么冷漠，给你个惊喜。”“什么啊？”小枫勉强的转过头。渡从怀中拿出一个精灵球“这是？”小枫慢慢的站起来。“爸爸说，明天是你七岁的生日，他太忙了，让我过来的。这是一只迷你龙，可是我的哈克龙的后代，潜力无限哦。”渡将手中的精灵球递给小枫，他接过精灵球。“谢谢。”“你终于对我说谢谢了，太高兴了！明天我会给你准备一个超大的party的。”是啊，他来到这个世界已经七年了。四岁时，被大针蜂攻击时，美洛耶塔出现。五岁时捡到的蛋孵出来波克比，还救治了一只受伤的藤藤蛇。六岁时，找到了拉鲁拉斯并且孵出来好运蛋。前几天在一个山洞里得到了勾魂眼。这六只精灵都得到了。“出来吧”小枫放出了迷你龙，一条蓝色可爱的小龙缠上了枫………
三年后，“波克基古，水之波动奇鲁莉安，魔法叶幸福蛋，重力场青藤蛇，青草搅拌器勾魂眼，偷袭迷你龙，龙之怒”无数的绝招交汇。这是枫痕在训练他的精灵们。而一旁渡正在草丛里偷偷的看着，他可爱的弟弟。“草丛里那个，出来”突然，小枫冲着草丛说了一句话。而渡还装作没听见，蹲在那里。“美洛耶塔，气合弹”一个棕色的球直接冲了过去。“啊，快龙用守住。”千钧一发之际，渡放出快龙挡住气合弹。“你这是谋杀啊。”“谁让你偷看来着”。。。。“我那是关心你，对了小枫明天你就10岁了，要出去旅行了，你准备在哪个地区旅行？”“关东吧”“好的，明天我就带你去真新镇”
第二天早上。
两人赶到了大木研究所。“大木博士，好久不见”“呀，这不是渡么？你不是有很多任务么？”“这不是这个不让人省心的弟弟么？”“这就是小枫吧，渡经常和我谈起你。”面对对面的猥琐老头，小枫淡定的说了句“哦”。。“还真是冷淡啊”“爷爷，我是不是第一个到的”一个棕色刺头的小帅哥走了过来。“天王渡，啊啊啊啊！”。。。?不一会一个棕色头发的女孩也到了。大家互相认识了一下“好了，就不等小智那个笨蛋了，我要杰尼龟。”说完小茂就拿起杰尼龟的精灵球。“小枫，你呢？”“小火龙”剩下的妙蛙种子也就归那个女孩所有了。“小枫，来对战吧，就算你是渡的弟弟，我也一定会赢的。”“没兴趣”说完小枫就往外走。“你是不敢了吧，胆小鬼。“”呵呵。”小枫的嘴角上扬。“要决斗走吧，去场地。渡心里明白小枫这是想虐小茂了。“杰尼龟，看你的了”小茂放出了杰尼龟。“青藤蛇，马上结束战斗，青草搅拌器，青藤蛇一甩尾巴，无数的叶片飞出冲向的杰尼龟，直接把它打飞了五米开外。“结束了，再见”小枫冷漠的走出去，只留下小茂一个人在哪里。“记得，有事联系我。”渡喊道。“知道了”他继续向前走，当然也碰到了并认识了智爷。
漫长的路程，小枫走到了河边。一个穿着漏肚脐衣服的橙发少女在钓鱼，小枫，准备无视她，在他刚要离开时，小霞突然转过头。“哇，好帅啊，你好帅哥，我是华兰市的小霞”“烟墨市，枫痕”“枫痕，希望我们还能再见面”“嗯，他嘴角上扬，这就是原著女主啊。也就是这一个笑容彻底迷住了小霞，而他没想到也正是这一个笑容让一只精灵成为了，他的主力。他走后，一只棕色的身影跟上了他。他继续向前走。“好，开始训练，小火龙，练习尾巴的力量以及火焰威力。勾魂眼跟着小火龙训练，领悟鬼火。迷你龙向瀑布冲击，幸福蛋向美洛耶塔学习十万伏特，奇鲁莉安练习格斗术，波克基古，向奇鲁莉安学习影子球，向青藤蛇学习阳光烈焰。青藤蛇练习刀叶。开始行动”。。
时光飞逝转眼就到了下午，突然下起来小雨，枫不得不收起精灵们，抱着迷你龙向前跑去，突然前方出现超大闪电，他知道这是皮神发威了。慢慢的天转晴，天上飞过一只七彩大鸟，小枫也把它拍了下来，然后向前走去。“小智，你没事吧”“小枫，你说我是不是很没用”小枫笑了笑，伸出一只手，霎时间金光闪过，皮卡丘的伤慢慢痊愈了。“走吧，去常磐市。”
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到了宠物小精灵中心已经是晚上了，小枫给父母打了个电话后带上耳塞睡着了。然后，发生了什么，就可想而知了。
另一天早上，小枫踏入了常磐道馆。“有人么，挑战道馆”“比赛规则是2对2，胜利你就可以获得绿色徽章”坂木从对战台上升起来。“好的，迷你龙，你上吧”“有迷你龙，不简单啊，不过那么小的东西可没什么大用处铁甲暴龙”一大一小构成了鲜明的对比。“迷你龙，不要怕，用水流喷射，小小的身躯瞬间被水包围，冲向铁甲暴龙“铁甲暴龙，用击落”庞大的身躯投出巨大的石头直接砸向迷你龙“不好，迷你龙，水之波动防御。6个蓝色的水球出现一合成一个水盾挡住了石头。“铁甲暴龙，用尖石攻击，无数的石刃飞过，“龙之怒，配合水之波动，”一条龙的身边缠着12个蓝色的球一冲而过（青龙兽，就决定是你了，呀串戏了）两股力量冲击。“铁甲暴龙，用地震。”“迷你龙对地面用龙之怒。”迷你龙直接被龙之怒的反作用力顶飞起来，现在，快用水之波动。一个蓝色的水球直接砸过去
一个蓝色的水球直接砸过去击中了铁甲暴龙。“石刃”迷你龙没有躲开直接被击中。“最后一刻，迷你龙吐出来一发龙之怒。引起了爆炸。白烟散去，迷你龙躺在地上，眼睛成蚊香状。而铁甲暴龙在一旁喘息。“波克基古，为我带来胜利吧，用水之波动“最后铁甲暴龙也失去战斗能力。…………最后坂木的隆隆石被波克基古的天恩配影子球大幅度降了特防，有被水之波动弄得混乱最后阳光烈焰结束了战斗。“少年你赢了，这是你的徽章。”小枫大步走出了道馆“来人，给我调查一下他”
小枫治好的迷你龙后走进来森林，突然身后的草丛动了一下。“这个感觉。。青藤蛇用青草搅拌器。突然小枫放出了青藤蛇对着草丛发出了无数的叶子，沙奈朵，魔法叶。两波叶子相对接过青藤蛇更胜一筹。多余的叶子直接飞向草丛里的那个人。“美洛耶塔，念力”在叶子即将击中时，小枫命令美洛耶塔用了念力定住了。“还玩么？”“不玩了不玩了，枫哥，这么久没见，也就是见面礼么？”出来了一个美丽的女生。她就是渡的堂妹，也是小枫的妹妹，御龙月。“月儿，别生气”“╭(╯^╰)╮，作为补偿，我要和你一起旅行。“你不用上学么？”本姑娘前几天拿到了毕业证可以直通石英大会，所以我出来历练一下”“那好吧，”于是两人踏上了旅途。在他们走后，一个棕色的身影跟了上去
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