南瓜棉腐病主要危害果实,也可危害叶、茎及其他部位。果实发病初期形成水渍状圆形或不规则形病斑,边缘不明显,病斑迅速扩大,导致果实腐烂。病部表面通常密生绵絮状白霉。受害果实变黄褐色,病部长出毛绒状白霉,可与疫病、炭疽病相区别。
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