南瓜蔓枯病是真菌小双胞腔菌引起的。病菌随病株残体在土壤和种子上越冬，第二年靠风雨传播，从气孔、水孔和伤口侵入发病。种子带菌的苗期即可发病，病部病菌可以进行再侵染。气温在20℃～25℃、相对湿度高于85％、土壤湿度大、高温多雨、种植过密、通风不良、连作地、反季节栽培等情况下易发病或发病较重。此病近年呈现越来越重之趋势。
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