巴耶克潜入卫城，周围有罗马士兵在巡逻。但卫城南北向的中轴线敌人布防非常空虚，所以巴耶克可以轻松抵达大厅，然后爬到二层的窗户进入到大厅内。
狮子弗拉维厄斯一早就注意到巴耶克的到来，所以接下来就是倒数第二场BOSS战。
弗拉维厄斯利用伊甸碎片的能力，发动攻击。
首先他使用了隐身，隐身这招也会拓展到接下来出现的一些小兵和队长身上，当巴耶克正面攻击他们时，他们是不会受伤并且进入隐身状态，但可以留意画面中一些扭曲的位置，从而判断出那里有敌人，就可以对这些“扭曲”位置进行攻击。
另外一招就是弗拉维厄斯放出的震荡波会令到巴耶克无法动弹，这时候必然会受到弗拉维厄斯的攻击，要避免中招，当画面四角出现黑影时（像似闭眼一样），巴耶克就得立马远离弗拉维厄斯。
战斗期间弗拉维厄斯每当丢掉30%的血量就会召唤出小兵和队长出来助阵，而他就会暂时躲起来，要击杀这些小兵、队长后，弗拉维厄斯才会再度登场。
终于，巴耶克打倒了弗拉维厄斯，但这狂徒死到临头嘴巴依旧猖狂，他表示这辈子最不后悔就是杀死了巴耶克的孩子。
就在巴耶克要取弗拉维厄斯性命时，他下不了手，原因是倘若弗拉维厄斯死了，巴耶克担心卡慕去到了芦苇原，巴耶克的内心会永远失去他的孩子。
这时候卡慕的“卡”出现了，儿子将弗拉维厄斯送往冥界，并表示会在芦苇原等候父亲（此时巴耶克取得伊甸碎片）。
巴耶克来到亚历山卓艾雅的基地，他们正打算去罗马宰了赛普提米欧斯和凯撒，巴耶克奉劝妻子放弃这愚蠢的执念。可是艾雅他们没有理会巴耶克的话（随后巴耶克将伊甸碎片放入宝箱内）。
接着巴耶克去到海滩与艾雅进行最后的交谈。
艾雅坚信他们二人的感情是没有开花结果的机会，因此她选择单方面提出沙滩分手，巴耶克虽然难以接受，但亦顺从艾雅的决定。
埃及已经沦陷了，希腊也是，而罗马沦陷也只是迟早的事。所以两人决定建立一个组织对抗维序者，当他们进行暗杀时，他们只暗杀那些罪有应得之人。那些试图控制人类的病态灵魂们，但他们永远不知道“无形者”是谁，艾雅和巴耶克的组织成员是冷血而心思慎密的杀戮诗人。
当巴耶克临别时，他将一个猎鹰的头骨丢在了沙滩上，当艾雅将骸骨取起时，发现了沙滩上留有代表“刺客信条”的徽记。(这就是刺客信条徽记的由来）。
（第勒尼安海，西元前46年）艾雅与巴耶克分手已经有段时间了，可是她内心暂时还未能放下，达玛斯忒斯一手将艾雅手中的守护者徽记抢了过去，这可惹毛了艾雅，她一手夺了回来。
弗希达斯上前开导艾雅，令到她的思维廓然开朗，她把徽记扔入大海，崭新的一天开始了。
（罗马，庞培剧院，西元前44年，五月十五日）
凯撒已经成为了“维序者”之王。艾雅在广场中击杀了赛普提米欧斯。这是与他的第二场战斗，这一战，他的武器上会添加伊甸碎片的附魔，攻击范围会加大、攻速也会加快。
不过打法跟巴耶克之前一样，都是等到他收招的时候，艾雅绕到他身后发动攻击。
杀塞普蒂米乌斯的时候，他居然说了一句，“凯撒就是洞察之父”。
认知之父（Father of Understanding)，或译作理解之父和洞察之父）是一个圣殿骑士发誓对其忠诚并寻求指引的存在，特别用在入围仪式或作为问候的方式。难道凯撒就是洞察之父？又或者这只是一个象征？又或者代号？
杀死了胡狼赛普提米欧斯之后，艾雅进入到西面的楼宇，去到二层找到一棵树，顺着它就可以去到元老院议事厅前的花园。然后落到南面的花丛中，借助草丛杀掉附近三名士兵，然后穿过议事厅的门。
进入议事厅，艾雅披上白兜帽，潜入到人群中，从凯撒背后捅了一刀，随即其他兄弟会成员也上前补刀。
最后落一刀是属于凯撒的儿子布鲁特斯。
凯撒自称自己是神，而且认为这个国家永远都不会落入艾雅或埃及人之手。然而，自由不是神施舍的，而是人们争取而来的。
（罗马外围，两天后）艾雅去拜访克丽奥佩托拉，艾雅并没有在克丽奥佩托拉孩子面前动手，她请求艳后做一位明君，不然任何事都不能阻挡她的利刃贯穿克里奥佩特拉的喉咙，而且艾雅也明了表示，克丽奥佩托拉是最后一代法老。
艾雅的书信（兄弟会宣言）：
（罗马，万神殿区，西元前43年）
巴耶克，凯撒已被刺杀，赛普提米欧斯也已经身亡。我在罗马的中心创立了一个据点，还没有人知道我们的存在。像阿蒙一样，我们是――无形者。
自由，说来讽刺。我们让彼此自由，却不曾让我感到快乐。我们必须向前迈进。沉浸在我们对鲜血诗篇的渴望。尽管结局尽是我们欢舞，他们死亡。
我们来自黑暗，也必须驻足于黑暗之中。人类不必永生，但是教条将会长存。教条是世上唯一不灭的事物。
别让任何事物令你肝肠寸断，因为人生苦短而时间终将吞噬一切。此刻，我不再是过去的自己。我已抛弃了我曾拥有的所有的爱。
我抛弃了艾雅的身份，扼杀了艾雅的人格。如今，我是无形者，以阿蒙内特之名。
祝你战无不胜。
经过这起事件，巴耶克，阿蒙内特还有无形者们都决定要将教条传达给那些起过誓言的人。阿蒙内特隐藏在罗马，不会述说英雄们的故事，只会传达纪律与坚持。教条将发扬广大，兄弟会将永不停歇。
走出据点，老鹰赛努依然在空中翱翔，这一刻巴耶克仿佛看到了无形者兄弟会所要追求的：自由的曙光。
伴随着激昂的音乐，Assassin's Creed Origins:The Hidden Ones的LOGO浮现在屏幕中，刺客信条起源的主线故事到此结束。
……
龙飞的任务也终于结束了，在主线任务中，龙飞以埃及神祗的身份帮了一点小忙，但没有改变历史走向。
任务完成，系统的提示音也传来：
『任务同步100%，奖励无形者刺客服一套。』
一套埃及风格的刺客服出现在龙飞身上。
在无形者DLC的开篇，八爷已由最初的创始人变成了伟大的刺客导师，属于八爷的刺客大师服装也如约而至。
在经历了八爷原始套破烂的围巾之后，新版服装的兜帽着实让人眼前一亮，虽然兜帽效果没有原画那么挺实那么亮丽，但却更加真实。而另一亮点则是袖剑护手甲，带着飞鹰羽翼的无形者标志得以完整展现，细致纹路也均已三角为主，符合埃及特色。
此外从整体上看，服装融合了狮子(腰带)圣甲虫(肩甲下沿)飞鹰(护手甲)等诸多埃及元素，那一抹红色的腰摆束带，也更为八爷添加了一份骚气!至此，无需换其他衣服了~
此外八爷原味套再度改版，去掉了之前被诟病的护腕甲，重新回归朴素。而袖剑护手甲则与无形者服装统一更新为完整的刺客标识。
“还可以。”龙飞看看无形者套装，点了点头。
“系统君，任务都完成了，我可以离开了吧？”龙飞问。
『呃……这个，有点，小麻烦。』系统的声音有点着急。
“什么麻烦？别告诉我出了bug。”
『嗯，出了一个小小的bug。』
“哈啊？你说小bug肯定是大问题！快说！到底怎么回事？！”
『你的思维在Animus里。它可以将基因记忆投射到三维世界中。不过嘛，人类科技太原始，引起了一些程序错误，如果不修复，现实世界的你无法醒来。』
“这尼玛还叫小bug！？算了，告诉我怎么修复？”龙飞不耐烦的说。
『系统会帮宿主传送到bug区域，宿主要清理错误的程序生物。』
“那好吧，只要能回去就行。”龙飞答应了。
『开始传送，《刺客信条起源》法老的诅咒DLC。坐标1』
『所处时间线：未知。』
『地点：阿玛尔纳，阿顿大神殿』
『任务：在死后世界击败阿肯那顿法老，结束法老的诅咒』
『奖励：未知？』
