对于意志本土航空基地的突击，因为距离利坚军半赛岛轰炸机基地在八百海里以上，只有航母舰载机和B—29重型轰炸机能够到达，由于航母编队已经在海上征战多日，又要在即将开始的生崇岛登陆中担当海空掩护的重任，迫切需要在战役开始前进行休整，而B—29又归利坚国陆军航空兵的战略空军部队指挥，所以米兹向陆军航空兵司令阿诺德上将提出了请求，但阿诺德认为这是纯属战术性质的任务，不愿出动宝贵的B—29重型轰炸机，双方各执一词，互不相让，米兹一面表示海军浴血苦战，伤亡惨重，全是为了替战略轰炸机取得基地；一面以“战略空军宪章”中规定的战区总司令在紧急关头有使用战略轰炸机的权利，居理力争，阿诺德只得作出了让步，同意将B—29用于对意志本土飞机制造厂和航空基地的轰炸。
从三月九日开始，第二十一航空队司令李梅少将为提高对意志军事工业的轰炸效果，将原来采取的白天高空精确轰炸战术改为夜间低空轰炸，并拆除了B—29上除尾炮以外所有机载武器，这样就使B—29的载弹量增至七吨，而且全部使用燃烧弹，这一战术称为“李梅赌注”或“李梅火攻”，当晚三百三十架B—29在达斯根投下了近两千吨燃烧弹，将达斯根四十二平方公里城区化为一片废墟，建筑物被毁二十五万幢，一百余万人无家可归，平民死亡达八万人，伤十万人。利坚军随后又以同样战术组织了对生崇岛附近其它城市的大规模轰炸，至三月十九日共出动B—29约一千六百架次，投掷燃烧弹近一万吨，迫使意志军将这些城市的飞机制造厂进行了疏散，从而大大降低了飞机产量。
三月二十七日和三十一日，利坚军第二十一航空队根据米兹的要求转而轰炸意志军在九朱的各机场，严重破坏了这些机场的设施，使其在九朱地区的航空兵几乎瘫痪。同一时间里，利坚军组织的攻势布雷又将下关海峡彻底封锁。利坚战略空军上述活动，严重阻碍了意志军海空军对生崇岛的增援，为生崇岛战役的举行创造了极为有利的条件。
为了彻底消除来自意志本土的空中威胁，利坚军第五舰队的主力航母编队第五十八特混编队，经十天的短暂休整，由编队司令米切尔指挥于三月十四日从乌利西基地出发，前往攻击意志本土，第五舰队司令斯普鲁恩斯以巡洋舰为旗舰，随同编队行动。
三月十七日夜，利坚军特混编队被意志军侦察机发现，对此意志军大本营内部出现了两种不同的意见，有的认为这是利坚军为在生崇登陆而实施的预先航空火力准备，应迅速进行反击；有的认为应当在登陆开始之后再组织反击，在情况未明之前不应轻易出击，以免不必要的损失。最后大本营考虑到航空兵力损失严重，新的部队正在突击训练，即使多训练一天，也是有益的，因此下令只要利坚军登陆的迹象不明显，就尽可能不动用航空兵，以保存实力。
三月十八日，利坚军第五十八特混编队到达距九朱东南约九十海里处，从凌晨开始出动舰载机对九朱各机场进行突击。意志海军第五航空舰队司令宇桓缠海军中将虽然接到待利坚军登陆编队出现时再出击的命令，但他认为如果不进行反击，任凭利坚军轰炸的话，他的航空兵力都将被消灭在地面上，因此仍下令出击。双方的飞机在空中交错而过，利坚军飞机在九朱上空只遭到了轻微抵抗，但机场上基本没有飞机，战果很小。而在利坚军攻击意志军机场的同时，一百九十架意志战机也对利坚军舰队发起了攻击，利坚军“叶期号”航母中弹一枚，一架意志军自杀机在“勇猛号”航母舷侧被击中爆炸，碎片落到航母的机库甲板，引起大火，舰上水兵死两人，伤四十三人，“约克城号”航母也被击伤，舰体被炸开两个缺口，水兵死五人，伤二十六人，所幸三舰伤势都还不重。意志战机则损失一百六十架。
三月十九日，利坚军航母编队出动了近千架舰载机对飞机制造厂和机场进行轰炸，意志军第五航空舰队也出动飞机反击。利坚军“枫黄”号航母中弹数枚，燃起大火，损管人员拼死搏斗，才将大火扑灭，舰员死一百人，伤两百六十人。但更大的灾难还在后面，七时许，利坚军“富兰克林”号航母正在组织舰载机起飞，一架意志军的“彗星”轰炸机借助云层掩护，突然俯冲而下，在三十米高度投下两枚两百五十公斤炸弹，一枚在机库甲板爆炸，另一枚落在舰尾，穿透两层甲板在军官舱附近爆炸，在机库爆炸的炸弹危害特别严重，因为航母正在组织舰载机起飞，机库里全是加满油，挂满炸弹的飞机，炸弹爆炸后立即引起了可怕的连锁爆炸，火势迅速蔓延，爆炸此起彼伏，大火引起的浓烟直冲云天，航母上几十架飞机都被炸毁，舰员伤亡已经多达数百人，爆炸和大火持续不断，并逐渐波及到机舱，“富兰克林”号上层建筑面目全非满是弹洞，甲板上遍布飞机残骸，大火蔓延到了后甲板的弹药堆，引起了更大的爆炸，烟柱高达六百米。“富兰克林”号所在的第二大队司令戴维森海军少将见航母伤势严重，通知舰长盖尔斯上校可以下令弃舰，但盖尔斯认为只要提供必要的海空支援和掩护，“富兰克林”号还能挽救。戴维森同意了他的计划，立即调动第二大队的其他军舰前来救援，“圣非”号轻巡洋舰用钢缆拖住“富兰克林”号以阻止其倾覆沉没，同时接下部分受伤舰员，舰长盖尔斯首先下令向弹药舱注水，以避免更大的爆炸，但注水后航母开始右倾。九时三十分，“富兰克林”号锅炉停止了工作，右倾加剧，甲板几乎碰到了海面，“圣非”号眼看无力控制其倾斜，担心被航母巨大的舰体拖翻，只得砍断钢缆。“匹兹堡”号巡洋舰接着赶来，布置钢缆阻止“富兰克林”号倾斜，经过不懈的努力，终于制止了航母的倾斜，“圣非”号再度靠近航母，将钢缆以前主炮作支点，系上航母，协同“匹兹堡”号一起矫正航母的倾斜。
在十八、十九日两天的突击中，利坚军损失舰载机一百一十架，有一艘航母遭到重创，四艘航母和一艘驱逐舰被击伤，在空中和地面上共消灭意志战机五百二十架，炸沉炸伤意志战舰二十艘，并对九朱地区的飞机制造厂和航空基地造成了较大的破坏，使九朱地区的意志军航空兵在此后的两周时间里无力组织大规模行动。
三月二十日，天气转雨，利坚军第五十八特混编队南撤，意志军因航空兵力损失严重，所剩无几，只以少数飞机进行了零星袭扰，有一架自杀飞机撞伤了一艘驱逐舰。
三月二十二日，利坚军第五十八特混编队与后勤支援大队的补给船只在海上会合，进行了海上补给，补充粮、弹、油。
三月二十三日，利坚军第五十八特混编队到达生崇岛以东一百海里水域，开始对生崇群岛进行预先航空火力准备。意志军大本营还以为不过是利坚军航母编队向乌利西返航时的顺便之举，并不以为然。
三月十六日，基利军第五十七特混编队从马努斯岛出发，二十日抵达乌利西基地，进行补给和短暂休整，三月二十三日，从乌利西启航，向先岛群岛航行。
三月二十六日拂晓，基利军到达先岛群岛主岛达尔岛以南一百海里处，随即出动舰载机对岛上机场实施突击，这支航母编队共有四艘两万吨级航母，排水量与利坚军的“埃塞克斯”级航母相差无几，但舰载机只有三十六架，仅为利坚军航母载机数的一半，原因主要是基利舰飞行甲板以及弹药舱、机舱等要害舱室都有五十毫米厚装甲钢板，这在后来同样面对意志军自杀飞机的亡命撞击时，基利舰生存能力要比利坚舰强的多，但由于舰载机数量少，利坚军斯普鲁恩斯命令德金海军少将指挥的第五十二特混编队第一大队的护航航母与基利军航母协同作战，共同对先岛群岛和万泰北部的机场进行压制性轰炸，经过数天空袭给予意志军在这一地区的航空兵力和机场设施造成了严重损失。至此，在利坚军登陆编队到达生崇岛海域前，第五十八和第五十七特混编队就已经有效地削弱了意志军在生崇群岛北南两个方向的航空兵力，进一步孤立了生崇岛守军。
利坚军登陆编队司令特纳在制定生崇岛登陆计划时就提出先以部分兵力夺取约克岛，但遭到几乎所有人的反对，他们觉得约克岛地形崎岖，无法修建机场，对于生崇登陆作战没什么价值，如果实施登陆，将会遭到意志军猛烈的航空兵力攻击。三月十七日，利坚军第五十二特混编队司令布兰迪海军少将、第五十一特混编队第一大队司令基兰海军少将、陆军第七十七师师长布鲁斯陆军少将和水下爆破大队大队长汉隆海军上校一起制定了约克岛登陆计划，根据空中侦察，发现意志军在约克岛的防御非常薄弱，他们遂改变了特纳原先以一个加强营的兵力逐个攻取的设想，决定以七十七师主力在六个较大的岛屿同时实施登陆，力争一举夺取约克岛。
三月二十三日，利坚军布兰迪海军少将指挥由十八艘护航航母、十五艘驱逐舰、十九艘护卫舰、七十艘扫雷舰以及一些炮艇、猎潜艇等小型舰艇组成的第五十二特混编队，其任务是对登陆作战实施支援，也被称为两栖支援编队，开始对生崇岛接近航道进行扫雷，护航航母则出动舰载机对生崇岛、约克岛意志军进行轰炸，以掩护扫雷行动。
三月二十五日，利坚军支援编队中的两艘巡洋舰和三艘驱逐舰对约克岛实施预先火力准备，同时掩护水下爆破大队侦察各岛屿登陆地点的海滩情况，结果发现久场岛和屋嘉比岛两岛屿预定登陆点的水下密布暗礁，登陆艇无法直接驶上海滩，只能使用履带登陆车，这样一来，现有履带登陆车的数量就不能满足在六个岛屿同时登陆的需要，因此利坚军临时改变计划，先只在其他四个岛屿登陆。
三月二十六日凌晨，利坚军戴约少将指挥的第五十一特混编队第一大队的十一艘战列舰、十一艘巡洋舰、二十四艘驱逐舰和八艘护卫舰对生崇岛实施炮火准备，吸引意志军的注意力，掩护在约克岛的登陆。
四时三十分，利坚军支援编队开始对约克岛实施登陆前的炮火准备，七时许，第七十七师由四百三十余艘登陆舰艇运送，兵分四路，在海空火力支援下，同时在坐间味岛、阿嘉岛、庆留岛和外地岛登陆，意志军抵抗非常微弱，至黄昏时分，利坚军已占领上述四岛，并开始在庆良间海峡布设浮标等锚地设施。入夜后，意志军以自杀飞机和自杀艇对登陆利坚军进行了特攻袭击，虽给利坚军造成了一些损失，但对整个战斗已没有多大影响。
三月二十七日，利坚军扩张战果，向其余岛屿发展进攻，很快就占领了整个约克岛。
三月三十一日，利坚军七十七师又占领了约克岛与生崇岛之间的庆伊濑岛，由两个155毫米炮兵营组成的野战炮兵集群迅速上岛建立阵地，以便支援从次日开始的在生崇岛的登陆。利坚军攻占约克岛后，下一个目标毫无疑问就是生崇岛了，而对生崇岛的炮火准备从三月二十六日就已经开始了。
三月二十六日四时，利坚军德约少将的第五十一特混编队第一大队开始炮击生崇岛，天亮后，利坚军第五十八特混编队的航母舰载机和第五十二特混编队第一大队的护航航母舰载机以及从马里亚纳、律宾基地起飞的陆军航空兵也对生崇岛进行了持续而猛烈的轰炸，参加轰炸的飞机数量多，任务也各不相同，有的对意志军机场进行压制性轰炸；有的轰炸意志军防御工事；有的为舰炮火力进行校正；有的担负空中警戒；有的进行反潜巡逻……为了有效地进行组织协调，利坚军专门成立了由帕克海军上校为队长的空中支援控制分队，对所有参战飞机进行统一指挥和协调。
三月二十九日，因为利坚军扫雷舰已经将接近生崇岛航道中的水雷清扫干净，所以战列舰、巡洋舰能够驶到距生崇岛很近的距离，进行精确射击。至三月三十日，利坚军的火力准备已经进行了足足五天，而意志军的反应令人诧异至极——没有任何还击！要知道在生崇岛上有着十万意志军，却跟什么都不存在一样，让利坚军感到非常奇怪。
