一切尘埃落定，自从添了一位小皇子，两位小公主，皇帝成日春风满面，没多久，富察贵人在某个给皇后请安的早晨显露了孕事，给后宫增添了一桩新的喜事，被封为慎嫔。
后宫喜事连连，前朝也一派祥和之气，西南战事节节胜利，赫赫大军已经派遣使臣求和。消息传来，宫中上下无不欢欣鼓舞，皆道年家之功，去巴结华贵妃的人都要踏破了翊坤宫的门槛，因此华贵妃并未在意襄嫔的离去，或许在她眼中曹琴默可有可无吧。
而一旁家族因功被抬为甄佳氏的莞妃相比则要逊色许多。宫里的戏一出接一出的永远那么热闹，而前朝局势越来越紧张。
等着过了盛夏，回到紫禁城里，皇帝终于要对宫外互相勾连的敦亲王与年家动手了，而正也正是甄嬛所期望的。
甄嬛抱着孩子与陵容，眉庄坐在永寿宫的主殿里，殿门口是层层手持棍棒器皿的太监宫女。兵戈相交的厮杀声隔着厚重的宫门传进来，空气中还有散不去的血腥味，众人神色紧张，坐立难安。
次日晚上，一队侍卫停在了永寿宫的门口。
“娘娘大喜，叛军已被击退！”小允子踉跄着从外头跑进来，甄嬛等人总算松了一口气，神色也舒缓下来。
“外头这时候还不太平静，眉姐姐，陵容你们不如先在永寿宫歇息一晚，明早再回。”
“也好。”见她们同意，甄嬛忙让潋紫领着宫女去安排，小允子则依然带了小太监去前后宫门处看守着。
这夜，依然不安稳。而甄嬛看着识海中的无间幻方在发呆，原来无间幻方中上灵界中突兀地多了两个沉睡的魂魄，甄嬛百思不得其解。
而在翌日，甄嬛听到前夜华贵妃强闯景仁宫用匕首刺死皇后后自尽，这才明白这两个魂魄应该就是宜修与年世兰。
而当夜皇后当时正与齐妃慎嫔说话，齐妃为救驾受伤昏迷未醒。这
甄嬛沉默了一会儿，几日前她将欢宜香与在王府时，为何会失去她的孩子的真相告诉了华妃，不过将皇后在其中的作用夸大了后，于是便有了现在的局势，甄嬛除了喜悦，还多了一桩心事，她们两人的魂魄怎会出现在上灵界。
而想到华妃，不由感叹道，满宫都是纯元的影子，唯独她年世兰就是年世兰。或许皇帝心中也是有她的吧。
“咱们去景仁宫看看吧，皇上怕还无暇顾及。”敬贵妃等人面面相觑，齐齐叹了口气。
这场平叛，皇帝可以说是惨胜。
皇后乌拉那拉氏被罪妃年氏刺杀身亡，追封为温裕皇后，齐妃李氏也被年氏所伤不治而亡，追封为齐淑贵妃。或许这比原著她们一个囚禁景仁宫，非死不得出，另一个则为弘时自尽的结局要好吧，毕竟此时皇帝的心中对她们只有愧疚与自责，而非最后单纯的厌恶。
而因为这一后一妃的身亡，年家的下场远比前生凄惨，九族诛尽。
温裕皇后入葬后，皇帝便晋端贵妃为皇贵妃，敬妃、莞妃为贵妃共掌宫权，又晋惠嫔，宓嫔，欣嫔，襄嫔为妃，怡贵人为怡嫔，其余微末之流皆有封赏。
年底，剿灭敦亲王与年家有功的几位功臣之女奉旨入宫册为贵人，不过因着皇帝的忌惮也翻不起什么大浪来。
次年，慎嫔诞下三皇子弘阳与公主静姝，但因上次年妃逼宫，身体一直不好，又是双胎因而难产去世，追封慎贵妃。静姝公主由皇贵妃抚养，而三皇子由敬贵妃抚养。自此，雍正后宫彻底由甄嬛把控，距离皇后也只是一个名头罢了。
雍正六年，浣碧被莞贵妃认作义妹改名甄玉隐与孟国公嫡女孟静娴一齐嫁为果郡王府，孟静娴为福晋，玉隐为侧福晋，与此同时还有一名唤作叶澜依的驯兽女入果郡王府为格格。次年孟静娴便诞下果郡王嫡长子永瑾，而后玉隐与叶澜依也分别诞下次子永辉与一女安和，叶澜依也升为了庶福晋。而剧中的江采蘋被孟静娴赐给了果郡王的小厮阿晋为正妻。
两年后，莞贵妃小妹甄玉娆嫁慎贝勒为嫡福晋，不久太后薨逝，皇帝苦于中宫无人，便册封莞贵妃甄佳氏为皇后，弘昭也顺利成章地成为皇太子。而这时甄嬛二十五岁，她便成为了一人之下，万人之上的皇后。
一年后，皇帝大病一场，病好后又逐渐沉迷于丹药之道，使得原就不好的身体更加衰败。
雍正十一年，养在圆明园的四阿哥弘历终于被皇帝想起了，于是便封为谨贝勒出园建府，赐乌拉那拉如懿为嫡福晋，为其四阿哥还特请甄嬛赐婚，因皇上本是想让钮钴禄氏一位嫡女为福晋，但弘历却向甄嬛诉说自己与如懿两情相悦，甄嬛欣然应允，毕竟这在封建社会难得一见。弘历与如懿婚后甜甜蜜蜜，纵有挫折，但仍旧携手一生，白头到老，他们还孕育了一双儿女永璟与璟兕，府中除了如懿，只有两位格格，一为绣娘珂里叶特海兰，她本为绣坊内一绣娘，与如懿关系莫逆，情同姐妹，入府五年后生下一女璟玉，另一位是侍女陈婉音，为人温柔宁静，平时只在房中作画，孕有一女璟安。
而大阿哥弘时封恭贝勒，章佳氏为嫡福晋，弘时自生母死后便一直默默无闻，出宫建府后愈发沉默，章佳氏为其孕有一子一女。
雍正十三年，皇帝服用朱砂所制金丹过量，加之身体虚弱，终于病入膏肓，不久后便于九州清晏驾崩。
皇太子弘昭于灵前继位，登基大典便安排在乾清宫举行，当日亦是册封太后的盛典。弘昭顺理成章地加封生母皇后甄嬛为“懿德太后”，入主慈宁宫。而此时甄嬛已经三十岁了。
而先帝诸妃中，端皇贵妃与敬贵妃封为端贤皇贵太妃，和敬皇贵太妃，惠妃与宓妃为惠仪贵太妃，宓佳贵太妃，襄妃、欣妃、怡嫔为太妃，其余为太嫔。
新帝仁孝，册封太后典礼极尽隆重，甚至超过了皇帝大婚的规格，普天之下，万民同庆，大清附属及邻近诸国皆派使臣前來纳贡相贺，贺新帝君临天下，贺太后母仪垂范。
新帝登基，年号明熙，史称明熙帝。明熙元年，皇帝年幼，太后垂帘听政，为稳朝局，太后懿旨，封果郡王为果亲王，慎贝勒为慎郡王，辅佐幼帝。
凤座高位如能凌云，然而其中冷暖，如人饮水。
冬去春来，周而复始。倚梅园的玉蕊檀心梅开了又谢，幸而甄嬛身边还有陵容、眉庄与淳儿在旁扶持，一同走过这后宫最后的岁月。
明熙十六年，身体本就虚弱的端贤皇贵太妃就先于前帝其他太妃去世，而静姝公主在其去世后，守孝三年。
之后五年，和敬皇贵太妃，欣妃，襄妃接连去世，至此，甄嬛身边只剩眉庄、陵容与淳儿了。
明熙三十年，陵容到底因少时身体虚亏，撑不下去了。“二位姐姐，淳儿，陵容要先走了，陵容这一生为遇到各位姐姐和妹妹而欣喜，只是到底陵容福薄，不能陪你们到最后了”陵容的嘴角最后是微翘的，安陵容走后，甄嬛三人泣不成声。
两年后，眉庄也到底油尽灯枯了，临走前只说自己要去陪容儿了，只是为留下嬛儿与淳儿两人而内疚。眉庄去世后，淳儿也坚持不住，一年后含笑而逝。
明熙三十六年，皇太后甄佳氏于慈宁宫无疾而终，皇帝悲痛万分，加谥号“奉孝”，史书上著“昭明懿德奉孝太后”。
自此先帝后宫所有妃嫔全部逝去，所有恩怨情仇皆被历史的洪流冲刷消失。
