如果在不知敌军具体兵力的情况下，分兵而行，以后难免被对手所乘，各个击破。二是如果借此机会，全军破釜沉舟的直攻对方大营，能够攻破当然是好事，可是如果一时无法攻破，然后又被临安的明军抄了后路，那自家大军就陷入险境，到时候说不定满盘皆输了，自己能不能全身而退都是个大问题了。经过慎重思考，为了保证撤退战略的顺利完成，杰书决定全军即刻后退，尽快在南面建立起新的防线。
再说大明一方，沐剑声在带兵攻克了临安县之后，就派陈昌道留守这里，自己立刻带兵返回上塘的大营，主持对杭州的攻城战役。十二月十五日，经过几天的歇息调整之后，明军对杭州城展开全面围攻，一时间百余门火炮齐齐轰鸣，炮弹纷飞，不断落入城门四周。
李之芳一看明军全力攻城，立刻带人进行抵挡，奈何他手下的兵马都是久疏战阵的杂兵，面对这种跨越时代的作战方法毫无办法，明军密集的远程火力打击，迅速摧毁了几处城门和附近的城墙，也击垮了守军的侥幸和士气，还不等明军发起总攻，从当夜开始，守军就大量的逃亡和出城投降，仅仅一天时间，杭州城就剩余了不到一半的人马，李之芳无奈之下，只好统领亲卫，组成督战队亲自登墙作战。
可惜李之芳个人的力量太过渺小，丝毫扭转不了大局，他的那些亲卫们比之别的兵丁也强不了多少，不过一天时间，他个人就因为负伤，只好退回衙门养伤，而那些亲卫督战队面对炮火的威力，也迅速失去战心，开始出现了人员逃亡。就这样到了十二月十七日明军发起全面总攻之时，杭州北面和东面的城门和城墙上，已经没有了多少守军，明军几乎一鼓而下，就攻占了这个看似很难攻克的城池。
此战之后，少部分清兵向西南方向逃窜，与杰书的大军汇合，李之芳战死城中，让得知这一消息的杰书十分遗憾，他早先还希望此人能够成为自己有力的臂助，结果却殉城自尽，让杰书大失所望。要说杭州城下这一战，面对沐剑声这个后辈，尽管杰书竭尽全力，依旧是输得是毫无招架之力，自然十分气馁。
目前他虽然还拥有近十万人马，但是却以杂兵居多，而且在损失了最为精锐的一万多骑兵之后，基本就丧失了进攻和反击的力量，剩余的都是战力孱弱的杂牌军，可以说败局已定。而且在杭州附近作战，对方还有强大的水师提供帮助，所以优势很大，好在他早就意识到了这个结果，已经提前在桐庐富阳交界一带，依靠地势布置起了主要的防线，希望能够延缓明军前进的脚步。
再说明军攻克杭州，随后经过一整天的清剿，彻底清除了城内残余的清兵，随后部分人马进入城内，接管了城防，然后明军集中力量，对城西的杰书军营发起攻击，熟料杰书早就实施了金蝉脱壳之计，城西大营几乎是空营一座，仅有千余伤兵在此虚张声势，让积蓄了足够战力的明军好好闪了一下腰。
得知杰书逃走，沐剑声虽然遗憾，却也不意外，毕竟如对方这等鞑子要员，岂会轻易就自陷于险地？于是立即整顿兵马南下追击，并借助余威攻克了萧山和富阳两地。随后在富阳南面的环山一带，明军与在此驻防的清兵遭遇，一番交战之后，清兵依托富春江的险滩和两岸的有利地形，打退了明军的进攻，随后双方在这一带展开了新一轮的对峙拉锯，于是整个杭州战役就此告一段落。
整个杭州战役，前后历时一月出头，最后明军取得共计歼灭清兵三万五千多人的战果，其中包括万余精骑，另外俘虏近两万人，大大削弱了清兵的有生力量，也是双方第一次，明军平定江南之前最后一场大规模的平原会战。此战双方在杭州近郊拉开架势，总的交战兵力超过十五万之众，清兵人数稍稍占优，然而由于明军装备精良，而且双方巨大的战力和战术的时代差距，加之清兵落后的保守战术，最后以明军速胜，清兵大败后撤驻防而结束。
此次战役，明军的损伤不大，累计阵亡者两千余人，受伤残废者一千余人，损失不到四千人，随后通过俘虏改造，又补充了近万人马，于是兵力不减反增。不过此战的收获却远远不及南京之战，因为此前杰书已经狠狠搜刮过地皮了，而且清兵逃窜的步伐很快，明军一方最终的缴获很少，所有的钱粮物资等累加起来，也就是几十万银两，不过聊胜于无。好在一点就是这里毕竟是一省首府，杰书还是稍稍的顾虑影响，没有敢在城内大肆抢掠人口，只是搜刮了一些附近村镇的农夫和流民精壮，城内的人员虽然被勒索了大量的财物，可是人身却得以保全，算是不幸中的大幸。
占领杭州之后，明军就占领了长三角的核心地带，随后派出偏师，在水师的配合下，进占了已经被清兵遗弃的宁波绍兴新昌等州府，拓地十余县，基本上尽收江南膏腴之地，可谓战果辉煌。因为连续作战多日，全军上下已经疲惫不堪，同时新占领的地方都需要安抚，而且还需要解决即将到来的粮荒问题，于是沐剑声下令停止进攻进行修整，安置流民，直到次年伊始，才开始进行下一步作战。
此后不久，沐剑声本人也将临时指挥部搬进杭州城，指挥各方部属全力恢复当地各项秩序，同时按照人口开始分发粮食，消除因为大面积缺粮而造成的恐慌。
眼下在明军占领区域里，其中已经有近二十个县遭到洗劫，超过百万人口陷入粮荒，而等到次年首季作物成熟，还有四个月的时间，这样算下来，扣除百姓家里的余粮，累计需要百万石粮食，才能够弥补空缺。以一艘海船可以运送万石粮食计，也需要百余艘次才能够完成这个任务，好在这些粮食只要分批次运来即可，这样王府下属的商船几乎齐齐开动，加入到了运粮的行动之中，在此后近两个月里，就从南方各地运送来了足够的粮食，及时解决了粮食危机，避免了民变。
也幸亏这些年王府在这一方面准备充分，大力扶持农业，打下了坚实的基础，因此储粮比较丰富，才能够平稳渡过危机，不过即便如此，这一次也将王府的存粮基本掏空，后续如果再想大批调运粮食，就需要在南方各地重新大批收购粮食才行。
再说在清兵一方，杰书率领三万多败兵退守桐庐之后，立刻汇合这里的数千兵马和两万多名辅兵，一面依托与富阳交界处，已经基本修建完工的防御工事进行后续防守，另一面派出手下大将，汇合从宁波、萧山、绍兴等地陆续后撤的人马，组织起了三万人的军队，在诸暨附近建立起一道新防线，护住大军的侧翼，准备再度阻击明军的脚步，从而为自己的焦土政策争取足够的时间。
随着明军攻克杭州的消息传开，明眼之人都意识到了江南战场的争夺战已经逐渐明朗，清兵溃败而后退出江南已经只是时间问题了。得到消息的明军各部也士气大涨，当然也有人因此而大受刺激。
第一位受刺激的人就是明军大将刘国轩，眼见主公一路攻城拔寨，席卷江浙，他却在这赣南之地坐看，自然十分的焦急和艳羡，决心也要作出一点成绩才是。虽然这次沐剑声北征时，抽走了刘进忠所部一万多人，但是在刘国轩麾下，还有刘一川曾养性两个主力师，加他自己本部一个师，兵力依旧达四万人，外加三个新兵团和万余守备部队，总计五万多人。此外以罗大柱李威武两人为主将的水师所部，在这大半年里也发展很快，如今已经突破万人，除开担负往返的运输任务之外，可以投入战斗的兵力接近七千人，实力依旧雄厚，所以他才有敢于放手进攻的底气。
不过出兵进攻这等大事情，刘国轩还想要询问赣州李西华的意思，毕竟对方是他名义上的上司，不能无视对方。当然为了说服对方，必要的进军计划策略也需要制定，随后刘国轩汇合了手下的众将和参谋，会商议定了一套详细的作战计划，然后前往赣州面见李西华。得知了刘国轩出兵的想法，又仔细查看了他的作战计划，李西华认为对方的计划比较完善，于是做主同意了出兵之事。
刘国轩的计划核心其实很简单，就是力争要一战攻克泰和，打开吉安府的门户，不过因为这几个月以来，虽然刘国轩曾经屡次派兵骚扰敌军，但是清兵一心稳守，双方却基本没有大的交火，而清兵在习以为常之下，难免会有所疏漏，自然就会露出一些破绽。
