当然，传统的家庭教育也是一项不可或缺的内容。家庭教育的内容大致可以分为让孩子受到传统文化之文化知识的文化化教育，让孩子通过实践掌握基本技能的训练化教育，让孩子懂得文明做人的文明化教育以及懂得礼仪处事的道德化教育。所谓文明化，就是通过让孩子与爷爷奶奶等传统文化积淀深厚的老人以及父母的引导教育，逐渐积累传统文化知识的过程。老人似乎又说不完的知识，孩子可以通过口头说教，逐渐吸收，融会贯通，在与长辈的互动中潜移默化地传承和习得无法在书本中学到的知识。在这样的教育过程中，英雄史诗《玛纳斯》、民间故事、传说、民革以及其他诸如部落谱系知识，民俗知识等民间文化知识不断被孩子吸收，逐渐成为孩子日后的精神营养。古代英雄人物的事迹通过老人之口灌输给孩子，使他们幼小的心灵得到净化和滋润。比如英雄玛纳斯坚忍不拔、无与伦比的精神气质，英雄的妻子卡妮凯聪明智慧、坚贞不屈、心灵手巧、美丽贤惠的性格都会给孩子留下深刻的印象。长辈们鼓励和教育后代要像英雄玛纳斯和卡妮凯那样，长大后成为对社会、对人民有用的人。所谓训练化教育，就是长辈们带着孩子一起劳动，在实践中通过不断地指点教孩子懂得和掌握更多的生活生产技能。比如说在柯尔克孜族社会男女分工不同，所以男孩子和女孩子学习的侧重点就不一样。男孩子从小就跟着长辈们放牧、骑马、狩猎及耕田、收割、打场等技术。女孩子则会跟着母亲或姐姐嫂嫂学习刺绣、制作花毡、挤奶、制作奶制品、家务等活计，逐渐成为母亲的好帮手。日后会成为设计和绣制花毡、壁毯、枕头、手巾等物品的高手而得到人们的赞扬。对于女孩子来说，这是一项必须掌握的技能。所谓文明化教育，就是要让孩子从小养成讲究卫生，节约粮食，保护环境的好习惯，懂得柯尔克孜族好的传统习惯，懂得为人谦虚热情，为日后做一个懂文明、讲礼貌的人。不如说饭前饭后洗手，不随地乱扔垃圾和大小便，保护草原，保护水源，对客人热情招待等等。所谓道德化教育，就是从小懂得尊老爱幼的习惯以及其他各种生活美德，并懂得传统禁忌等。比如，遇见长辈都要先热情问候，仔细聆听长辈的教诲，服从长辈，学会忍让、富有同情心和爱心等等。大人们总会教育孩子要诚实守信，不干坏事，多做好事，助人为乐等。这样的道德伦理教育，使得柯尔克孜族孩子长大后都会行为规范，合乎法礼，不轻易犯忌。
柯尔克孜族是一注重教育的民族。家庭教育毕竟是一种启蒙教育，孩子日后的培养还是要靠学校的教育。随着社会的不断发展，新式的学校教育开始逐步在广大柯尔克孜族草原山区得到普及。1933年底成立的“柯尔克孜族文化促进会”为推进柯尔克孜族民族教育事业做出了重大贡献。在这一时期，柯尔克孜柯文化促进会开始在喀什、乌什、乌恰、英吉沙、伽师、疏附、阿合奇等地建立一些新式学校，最多时达到13所。另外，喀什市还办有柯尔克孜族小学，喀什师范学校设有柯尔克孜族班。小学分中心学校和分校两种，有的是男女合校，有的是男女分校。学校的经费和学生书费等均由“柯文会”提供，入学的贫困学生每个月还可以得到生活补助。为了孤儿入学，“柯文会”还办有一些孤儿学校，这些孤儿学校学生的衣食住行都有“柯文会”负责支付。柯尔克孜族的子弟被派到喀什、阿克苏、乌鲁木齐等地中学学习的人数也不断增多，还有少数人到前苏联去留学。这一时期的民众教育主要是为了扫盲，成人教育也是由“柯文会”负责组织。但是，无论如何，“柯文会”所取得成绩毕竟有限，无法改变大部分柯尔克孜族彻底受教育的现实。有不少柯尔克孜族民众仍然接受私塾经堂的宗教教育，阅读和背诵宗教经典。1937年，“七七事变”后，新疆在抗日战争中的作用和地位日益显得重要。前苏联支援我国抗日战争的物资主要通过新疆进入内地。中国共产党为了加强在新疆的工作，把中央政治局委员邓发派来，并在乌鲁木齐成立了“八路军驻新疆办事处”，从而，来新疆的中共党员日益增多。1938和1939年，中共中央委员陈潭秋和毛泽民、林基路等先后被派到新疆工作。新疆财政厅在毛泽民任厅长期间曾拨专款在柯尔克孜族地区创办学校。到民国38年（1949年），境内的国立和文化促进会举办的小学达到40余所，在小学生人数达到600余人。应该说，新中国成立前，柯尔克孜族还没有一所中等教育学校，初级教育就是当时最高的现代教育方式。
新中国成立后，党和政府十分重视发展少数民族教育事业，在改革旧的教育体制，接收和改造旧学校的同时，建立新的教育体制，创办新型学校，使各族劳动人民的子女充分享受平等的受教育权力，所有的学校都向农村牧区的牧民子女开放，小学教育得到很大普及。到1954年，自治州成立时，境内已有小学53所，在学生增至13691人；中学一所，在校学生人数300余人。自治州成立，特别是民族区域自治制度实施后，国家每年都拨出大量经费用于发展教育事业。40多年来，国家为自治州的教育事业投资超过3亿多元，有力地保证了自治州教育事业突飞猛进地发展。
自治州柯尔克孜族牧民居住分散，流动性大，学龄儿童上学很不方便。为了解决广大牧民子女上学难的问题，自治州党委政府结合当地的实际情况，参考外地经验，在牧区试办了季节性学校、半日制学校、流动学校（马背小学）以及寄宿制学校。这些灵活措施取得了一定成效，为山区柯尔克孜族牧民子女入学提供了方便。其中季节性学校和半日制学校仅在20世纪60年代初期短暂实行后即停办。20世纪70年代初，自治州采用内蒙古自治区的经验，在全州普遍办起了“马背小学”，又称“流动小学”或“巡回小学”。由教师骑马到草原上的各个牧点草场，进入牧民毡房为学生授课。当时，在全州范围内，这种小学一度达到百所以上。这种方式虽然解决了牧民子女的上学难问题，但因为教学效果较差而在20世纪80年代初停办，并改为学生寄宿制学校。寄宿学校从此开始在全州范围内得到推广，不仅基本上解决了牧民子女上学的难问题，同时又保证了教学的质量。柯尔克孜族聚居区寄宿制学校的办学方法是，在乡镇或人口集中的地区建校舍，学生住校读书。学校除了任课老师之外，还配备了专门的炊事员、保育员、卫生员负责学生的饮食起居。国家每月给予学生一定的伙食、医疗费和取暖补贴。寄宿学校的推广，使得柯尔克孜族聚居区普及了小学教育。2000年，全州共有寄宿制小学37所，在校生9000余人。
克孜勒苏柯尔克孜自治州的普通中学教育是新中国成立后才从无到有逐步发展起来的。1953年，阿图什县建成第一所中学，这是自治州境内的第一所中学。1955年，改名叫克孜勒苏柯尔克孜自治州第一中学。此后不久，在阿克陶县、阿合奇县、乌恰县分别于1956年、1957年和1958年相继建立了柯尔克孜语中学。到1966年，全州境内已经建立有8所中学，在校学生人数达到2413名。“文革”期间中学教育受到很大削弱和破坏，但“文革”结束后很快得到恢复和发展。到2000年底，全州共有中学55所，其中城镇14所，农牧区乡镇41所。其中有51所用少数民族语言授课，专职教师人数达到2246人，在校学生人数达到30661人。
克孜勒苏柯尔克孜自治州的中等专业教育也是在党和政府的大力支持下，伴随自治州的成立与发展同步跟进的。1958年，自治州人民政府决定创办柯尔克孜族师范学校，解决全州牧区急需的柯尔克孜族教师奇缺问题。1961年正式命名为“克孜勒苏自治州柯尔克孜族师范学校”。但是，1962年底，因为当时一度错误地人为停止使用柯尔克孜语，这座刚刚开始起步的师范学校被撤销，给柯尔克孜族各项事业发展造成了极大的损失。1981年，随着柯尔克孜语在新疆从新恢复使用，克孜勒苏柯尔克孜族师范学校有得以恢复重建。克州其他一些中等专业学校也相继建立，比如1960年10月，为适应农业生产对农牧业科技人员的需要，克州政府创办了自治州农业学校。1972年，州医院创办卫生学校，1979年正式改为克州卫生学校。自治州还曾创办过财贸学校、技工学校等。80年代后期开始调整，到2000年底，全州共有州党校、自治州教师培训中心、州农业学校、州卫生学校、州师范学校等5所中等专业学校。
