关于此次海战中“无敌舰队”面对寡弱的对手之所以会如此不堪一击的原因，大致有三种说法：
第一种是说没有民众基础。西班牙的繁荣强盛其实只是表面上的。西班牙的国王腓力二世为了加强他的专制统治，便抢夺民财、长年征战、专横跋扈、奢华无度，激起了民众的愤怒，国内矛盾是愈演越烈。因此此次海战根本就是没有民众基础不得民心的。
西顿尼
第二种是说指挥失当造成的。也有学者认为，是由于西班牙国王用人不当，而造成“无敌舰队”的失败。西班牙此次海战的舰队统帅是大贵族西顿尼亚公爵，他出身显赫，在贵族中比较有威望，国王很信赖他。可是他原本是陆将，对于海战根本不懂，更谈不上对指挥庞大的舰队进行海上作战的经验了，更糟糕是他还晕船。而他也没有想到国王会任命他为此海战的舰队统帅，对这场海战根本没有任何的思想准备和信心，他也曾经要国王另请高明，可国王却不同意。有这样的将领指挥此次海战怎么可能不失败？
第三种是说天灾造成的。这种说法认为“无敌舰队”遇到的是天灾并非人祸。它最先遇到就是相当可怕而又不可战胜的狂风巨浪，这是由于进攻的时机选择不当而造成的。“无敌舰队”刚起航就遭遇了大西洋风暴的袭击，大量的船只损坏，仓促赶制的用来装淡水的木桶漏水，大量食物已腐烂变质，水手们已疲惫不堪，大部分的步兵晕船因而也基本没有了战斗力。因此，还没有与英国交战前，“无敌舰队”的战斗力就已是大打折扣了。西顿尼亚只好带着已失去战斗力的舰队与英军交战，最终导致了厄运的发生。不幸的是，在西班牙舰队回国时，他们在苏格兰北部海面上又一次遭到大风暴的袭击，剩余的部分舰船又被海浪吞噬或触礁沉没。“无敌舰队”至此基本上已是全军覆没。
