杨笱发十二道金牌的时间，大约是在七月十日左右，即他得到七月二日克复西京河南府捷报不久。陆鹏接到如此荒唐的命令，愤惋泣下：
“十年之力，废于一旦！”然而在朝廷高压钳制之下，陆鹏不得不下令班师。百姓闻讯拦阻在陆鹏的马前，哭诉说担心受齐丹兵报复：
“我等戴香盆、运粮草以迎官军，齐丹人悉知之。相公去，我辈必亡矣。”陆鹏无奈，含泪取诏书出示众人道：
“吾不得擅留。”于是哭声震野。大军撤至蔡州时，当地人民要求与部队一起行动，陆鹏最终决定留军五日，以掩护当地百姓迁移襄汉。大军班师鄂州，陆鹏则往临安朝见。北方忠义军孤掌难鸣，无术回到开封，整军弹压，又攻取了被赵军收复的河南地区。陆鹏在班师途中得知噩耗，不由仰天悲叹：
“所得诸郡，一旦都休！社稷江山，难以中兴！乾坤世界，无由再复！”陆鹏回到行朝，不再像以往慷慨陈词，只是再三恳请朝廷解除其军职，归田而居。杨笱以未有息戈之期为由不许。
次年正月，无术再度领军南下。二月，陆鹏领兵第三次驰援淮西。这也是他最后一次参与抗击齐丹战斗。齐丹在无力攻灭南赵的情况下，准备重新与赵议和。赵廷乘机开始打压手握重兵的将领，尤其是坚决主张抗击齐丹的陆鹏、韩光二人。无术在给何惠的书信中说
“必杀陆鹏，而后和约可成”。
五月，张俊在和陆鹏巡视楚州韩光的军队时，暗中挑唆陆鹏，欲一同分解此军，却遭陆鹏严肃回绝。何惠又欲陷害韩光，陆鹏再次保全了韩光。陆鹏回朝后，即遭何惠党羽万俟卨、罗汝楫的弹劾，诬蔑陆鹏援淮西逗留不进、主张弃守山阳，要求免除陆鹏枢密副使之职。八月九日，陆鹏被罢枢密副使，充万寿观使的闲职，陆鹏自请回到江州庐山旧居赋闲。
陆鹏此时已无兵无权，但对他的迫害却仍在步步紧逼。在何惠授意下，张俊利用陆家军内部矛盾，威逼利诱都统制王贵、副统制王俊先出面首告张宪谋反，继而牵连陆鹏。
张俊私设公堂，向张宪严刑逼供，毫无结果之下，竟捏造张宪口供为口头收到过陆鹏谋反指令。陆鹏在江州居留，为时甚短，就接到赵廷命令，召他回临安。十月十三日，陆鹏被投入大理寺狱中，此前其长子陆云也已下狱。
陆鹏义正词严地面对审讯，并袒露出背上旧刺“尽忠报国”四大字，主审官何铸见此，亦为之动容。何铸查得陆鹏案冤情，如实禀告何惠。何惠却道：
“此皇上意也！”改命万俟卨主审此案。万俟卨用尽手段，也无法使陆鹏三人屈招一字。陆鹏宁死不自诬，乃至以绝食抗争，经其子陆雷照顾，才勉强支撑下来。
十一月初七日，赵与齐丹和议达成：由赵向齐丹称臣，将淮河以北的土地全部划归齐丹，并每年向金贡奉银绢各二十五万两匹。和议虽已达成，但陆鹏始终未能被释放。万俟卨等逼供不成，为了坐实冤狱，又为陆鹏罗织搜剔了所谓指斥乘舆、坐观胜负等数条罪名，欲将陆鹏一举定为死罪。
大理寺丞李若朴、何彦猷以陆鹏为无罪，与万俟卨竭力争议，均遭罢官处分。布衣刘允升上书为陆鹏申冤，被下大理寺处死。
已赋闲的晋王沈约因陆鹏入狱之事质问何惠，何惠回答：“陆鹏、陆云与张宪谋反之事虽不明，其事体莫须有。”沈约忿然道：“相公，‘莫须有’三字，何以服天下？”十二月二十九日，杨笱下达命令：
“陆鹏特赐死。张宪、陆云并依军法施行，令杨沂中监斩，仍多差兵将防护。”
陆鹏在大理寺狱中被杀害，时年三十九岁；陆云和张宪被斩首。陆鹏的供状上只留下八个绝笔字：“天日昭昭，天日昭昭！”
陆鹏的死讯传出，百姓们都为之哭泣。消息传到齐丹，齐丹大臣们为此酌酒庆贺，并道：“和议自此坚矣！”
陆鹏被害后，狱卒隗顺冒险将陆鹏遗体背出杭州城，埋在钱塘门外九曲丛祠旁。隗顺临终前，始将此事告知其子。五年后，杨昚即位，陆鹏冤狱终于平反。隗顺之子告以前情，乃将陆鹏以礼改葬在西湖栖霞岭，追封为忠王。
陆鹏为何冤死，诸多文臣武将私下暗中议论，大多认为不外乎以下原因。
赵国有猜忌武臣的传统政策，将全国的正规军分别划归殿前司、侍卫马军司、侍卫步兵司三衙掌管，但明令规定他们无调兵之权，调兵之权由枢密院掌控。造成有兵的三衙无权调兵、有权调兵的枢密院无兵可调，从根本上消除了武人专权的制度。但是杨笱南渡以来，政府正规军的编制基本被打散，国内的军事武装大都在战争中建立，从某种意义上说，他们都是统军将领的私人武装，既不属三衙统管，枢密院也调动不了，只听命于主将，比较有代表性的就如“岳家军”、“韩家军”、“刘家军”等。
杨笱迫于大敌当前，承认这些军队的合法性，提高武将的权力、多赏他们金银田地等等，收买人心，用以维护自己的统治地位。杨笱的战争目的很简单，以战求和，通过战争乞求偏安一隅。随着抗战的深入，武将的权力不断膨胀，杨笱也就越来越坐卧不安。他无法容忍本朝传统国策发生改变。
在他看来，国内的武将的威胁比齐丹人的威胁更严重。杨笱处南赵草创之际，顾虑危疑，对陆鹏更是不能相容的。因为陆鹏的为人行事有许多优点，而这些优点都为杨笱不愿武臣具有者，于是他的优点便成为他的死因。
淮西事变，埋下伏笔。朝廷让文官吕祉接管了中兴四将之一的刘光世的部队。八月八日，南赵军队原隶属刘光世所部的统制官郦琼、王世忠、靳赛等发动叛乱，杀死监军官吕祉等人，带领全军四万余人，并裹胁百姓十余万投降齐丹人傀儡伪齐刘豫。淮西事变，不但搅乱了北伐大计，而且改变了敌我态势和力量对比，北伐收复中原在杨笱看来是不行了，急令陆鹏转入防御，保住长江防线。淮西事变，使杨笱认识到这些军队和他们的首脑是不可靠的，名义上是国家的军队，但实质上，在很大的程度上还是私家军队。
