毋庸置疑，占领南京城的军事意义十分重大，有了这里作为支撑点，沐王府大军就能够发挥水军的巨大优势，实现对长江中下游的迅速掌控，从而阻隔江南清兵与北方的联系，使之成为无根之木，这几处孤军的败亡只是时间问题。而一旦丢失了江南，清廷也就失去了最主要的财富基地，没有了这个后勤宝地，其整体实力顿时大损，战争的潜力也受到重创，从而被明军全面压制。
此战明军之所以能够速胜，提前的整体布局起了关键作用，所以在明军进攻南京的时候，四周的许多州府都接到了麻勒吉发出的求援文书，不过沐王府的布局已经全面展开，不但组织的民乱有效打乱了三省秩序，而且水军对于江面的封锁，也起了很重要的作用。
以安庆、扬州、芜湖、江阴等地为例，这些府县刚刚组织了一些军马，准备救援南京，就遭到了明军水军的袭扰攻击，立刻吓得连忙回军自保，哪里还敢去救援南京？而另外的苏州无锡湖州等地，则被义军袭扰，也不敢轻易出兵，至于常州，更是面临三万明军的攻打，自保都不容易，何谈反击？而另外的一处地方——杭州，倒是有不少的兵马，不过面对钱塘江外明军水师来往不绝的威胁，杭州城可不愿成为下一个南京，只能够紧守门户，坐视南京城陷落。
就这样，在四下各地的围观下，南京城很快落入沐王府手中。占领南京之后，沐王府迅速恢复了南京城内的秩序，同时为了提升士气，沐剑声又大肆封赏了一批有功人员，北征的主要将领几乎各自提升一至两级；而参与指挥各处民变的留守人员也大有封赏，从而使得三军振奋，甘愿效死，众将踊跃请战，以图再立新功。
随后沐剑声亲自在此坐镇，留下陈猛苏况两部，协助自己守卫南京；同时任命刘进忠为东线主帅，率领本部兵马一万多人和一万义军迅速南下，汇合常州的陈昌道所部，在守住常州的同时，设法攻略苏州无锡等地，稳定南京东南面的局势，力争扩大明军的控制范围。接着又任命张清山为西路明军主帅，带领一万义军西进芜湖，与吴立身部汇合。在攻克芜湖之后就着手就地进行整编，裁减老弱，提升战力。后续在水军的掩护下进攻铜陵池州等地，略定皖南，进逼安庆，安定南京西南面局势，扩大控制范围。至于南京北面，有长江天险凭借，凭借水师往来巡游盘查，反倒是最为安全的。
为了尽快消化稳定新占领的地盘，同时补充各种军资粮草等，沐剑声下令主力水师和后路水军即刻返航，除了巡航琼州吕宋等地，震慑四邻外，同时再从后方各个学院里面，紧急抽调运送一批骨干人员前来江南，分赴到江南各地任职，协助自己加强对这里的控制。
为了加强对义军控制各县的统治，沐剑声从亲卫里面挑出了几十人，各带一小队人马，分赴各县府安顿秩序，肃清残余敌军，统领地方事务，加强自己对于各处的掌控。在这些十分有效的政策下，南京城内及四周各县府很快恢复平稳，加上沐家军秋毫无犯的纪律，以及后续的各项惠民政策，让老百姓很快认可接受了沐王府的统治。
就在沐剑声忙于经营南京之时，这份战报也终于辗转传到了浙南、武昌、南昌三处清军大营，稍后送达京师，立刻在清廷内部掀起轩然大波，朝野内外一片哗然，大小官员震惊不已。
最先得到南京失守消息的，是坐镇南昌的清廷简亲王喇布，以及江西巡抚董卫国、都统珠满、提督赵赖、平南王世子尚之信等人，这个消息几乎如同晴天霹雳般，让这些大小鞑虏震惊失色，喇布珠满等人更是放声大哭，直言痛骂麻勒吉等人无能误国等等。这些人深知，一旦让明军在南京扎下根来，以对方的强大水军为利器，长江势必成为对方任意进退的交通线，那么江南清兵危矣！那么江南半壁河山立刻就前途黯淡了。在此情况下，喇布一面召集众人商议应对策略，同时向武昌的杰书发出消息，询问如何处理危局。
几乎与此同时，坐镇杭州的清廷浙江将军图喇、浙江总督李之芳等人也获悉了南京失守的消息，大惊失色。他们前几日才得知明军攻打南京的消息，立刻集结人马，准备救援，这才不过三五日时间，兵马才准备出动，明军就已经破城建功，这等攻击力让他们也心惊肉跳。李之芳更是急急亲领五千精锐人马北上，沿途不断派人收拢江苏方面的残兵，很快收拢了近两万人马。随后他于无锡一线遭遇明军前锋，于是就地布置防线，阻止明军南下的脚步。
同时，留守杭州的图喇连忙召集精壮，准备守城器具，设法加强杭州的守城兵力，以免受到了和南京城同样的待遇，此外他们又连忙发出信鸽，向衢州的康亲王报告这个重要的消息。
一天之后，岳乐和杰书几乎同时得知此事，双双失色惊倒，暗道天亡我大清也，不想以江阴要塞众多的火炮，那般强大的火力，都难以阻止明军水师，也就难怪南京城会迅速丢失，看来敌军大势已成，哀叹难以挽回败局。他们深知，一旦南京陷落两江失手，在这种困局下，两人都面临着两个方向的威胁不说，从此后勤补给就成为了最大的问题，后续作战立刻就变得困难许多，而杰书更是几乎被阻隔在浙江一地，陷入了敌方三个方向的包围之中，哪怕他兵力依旧雄厚，可是战略上已经处于劣势，面对这种十分不利的局面，两人连忙四下抽调兵马，准备反攻南京。
再说在大明一方，首先接到获胜消息的，乃是闽台两省，随着最先返回的部分水师船只到达，他们就获悉自家又取得一场十分关键的大胜仗，拿下了南京坚城，立刻都变得疯狂起来，两省大大小小的官员都喜形于色，陈近南和顾炎武下令各地大张旗鼓的庆祝三天。陈近南更是亲自前往郑成功墓前隆重祭奠一番，用此好消息来告慰这位已故英雄的在天之灵，弥补他的遗憾。
此后不久，广州和海口先后也得知这个消息。留守的白寒松、苏冈、李因笃等人也欣喜若狂，随后将这个好消息迅速传达到辖下各地，激励军队民心士气，并且连续举行了各色的活动来进行庆祝，一时间岭南各地是欢声笑语不断，各种庆祝活动此起彼伏，商家大多赚得盆钵皆满，百姓们也喜笑颜开，直到旬月之后，才逐渐归于平静。
再说说王府的大后方吕宋。自从沐剑声离开吕宋之后，整个群岛开始高度戒备，外松内紧，内卫人员全力出动，密切监控四方，在这里留守的王府高层人员，心里都捏着一股劲，从柳大洪赵京和郡王府，众人都在心里祈祷，盼望沐剑声能够马到功成，一举建功。
而后沐剑声带兵北征南京的消息也逐渐传开，从吕宋各个家族，以及基层军官，再到大小的土著首脑，上下都弥漫着一股紧张的空气，他们时刻关注着码头，紧盯每一位返回的船只，看看有没有战报传来，以便及时得知最新的消息，然后做出应对。
这种情况，以郡王府众人最为明显。如今的南海郡王府，在沐剑声离开之后，以王妃李月华为主事之人，桑小玉、陈阿珂、袁紫烟三位妃子为辅助，管理大小事务，这也是沐剑声亲自定下的规矩。不过因为各人的性格差异，所以实际上以李月华为首，掌管一些机密重要的事务，包括人事以及具体的对外接待事务，沈芳从旁协助她；桑小玉负责日常的生活采买等杂务，袁紫烟负责府库重宝之类的管理，陈阿珂则总管钱粮账务，这样每个人负责一摊，互相又有所制约，避免了某一人权力独大而野心膨胀。
至于剩下的黄鹂儿，她因为自家出身，非常自知的提出不参与管理具体事务，更多的时候都是在帮忙看护孩子，整日和那些带孩子的嬷嬷丫鬟之类在一起，她对每个孩子都十分爱护关照，有时候甚至不像是一位母亲，而更像一位大姐姐，所以王府上下人等都十分喜欢她，尽管她手中几乎没什么权力，反而是府里人缘最好的一位。
目前沐剑声有十子六女，最大的沐兴已经十岁有余，上了学堂，最小的沐越才两岁多，正是到处乱跑的时候。而且桑小玉和沈芳还有孕在身，另外还有一名丫鬟，也在一次沐剑声酒后的意外荒唐之后有了身孕，所以沐剑声又要再增添几个孩子，可为枝繁叶茂。因为孩子们都还小，内部的各种矛盾还在酝酿阶段，友爱亲情还是主流，所以王府上下的氛围还是团结和睦的。这些小家伙们，全然不知自家父亲在外面经历着何等的艰险，整日无忧无虑自由自在的玩耍，在四周一群大人的关爱看护下茁壮成长。
