（第一节）机构
市、乡（镇）两级组建以防汛、抗旱、水利冬修为一体的指挥机构。市设立防汛抗旱指挥部，乡（镇）设立防汛抗旱指挥所，重点水库设立指挥组。市指挥部由一名副市长担任总指挥，人武部长及水电局长担任副总指挥。2000年，调整后的瑞金市防汛抗旱指挥部成员单位，由市政府办、计委、农委、民政、财政、农业、林业、粮食、物资、邮政、电信、交通、商业、供销社、公安、卫生、广电、气象、水文、象湖镇等组成，人员由各单位主要负责人担任。指挥部下设办公室，办公室设在水务局，配备专干6名，负责防汛、抗旱、水利冬修的日常工作。
（第二节）防汛
横贯市境绵江的几条支流多发源于东、北部山区，山高岸峭，大风来时，常伴有山洪暴发，河水陡涨陡落，易成洪涝。常年汛期，一般在4～6月。
市委、市政府十分重视防汛工作，投入大量的经费和劳力。每年汛前层层召开防汛工作会议，预估汛情，部署防汛抢险，落实防汛工作责任制。全市中型、小型水库明确由市、乡领导挂钩负责的行政责任人和水利部门的技术人员负责。防汛指挥部成员单位主要承担挂点乡（镇）和1座重点水库的防汛责任。按照中型水库300人、小（一）型水库100人、小（二）型水库50人、重点山塘30人的规模组建防汛抢险队伍，受当地乡村领导指挥。防汛抢险使用的麻袋、木竹、钢材、水泥等物资均由有关部门定点定量储备。
每逢汛期，及时组织机关干部、基干民兵，分赴各灾区参加防洪抢险，组织生产自救，解决实际困难。
1986～2000年，市财政共计投入防汛资金453万元，年均投资32万元；投入劳力310万个工日，年均投劳26．6万个工日。其中，1988年特大春汛，政府投入防汛经费68万元，投入劳力55万个工日。
（第三节）抗旱
境内旱灾多发生在夏、秋季节，市委、市政府建立乡镇领导和抗旱指挥机构成员责任制，实行市领导和组成部门负责人挂点、乡（镇）党政领导包片、乡（镇）干部包村、村干部包组的分工负责制，具体协调解决抗旱工作中的人、财、物等到实际问题。
每年6月，市政府统一部署，各乡（镇）具体负责水利渠道全面清淤，确保各灌区水流畅通，为抗旱作好工程准备。与此同时，做好抗旱机具维修、添置，充分发挥抗旱设施的效益。1998年旱情较重，全市添置小型机（电）抽水机（泵）300多台。是年8月初，共动用机械设备680台，全力投入抗旱。
1998年以后，每当旱季，市防汛指挥部门组织水利、气象、人武部等单位，实施人工增雨作业。利用高射炮，将催雨弹射入云层，完成人工降雨、增雨，缓解旱情。
1986～2000年，市财政累计投入抗旱资金2840万元，年均投资189．3万元；全市投入劳力314万个工日，年均投工20．9万个工日。其中，1986、1998年，瑞金境内特大旱灾，市财政分别投入抗旱救灾资金328万元和461万元，投入劳力52万个工日和46万个工日。
